结论：员工调整为只发基本工资是否合法，需视具体情况而定。以下从不同角度进行分析：
一、合法情形
劳动合同或规章制度明确约定：
- 如果劳动合同中明确约定了，在特定情况下（如公司经营困难、员工待岗等）可以只发放基本工资，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么公司调整员工工资为基本工资是合法的。
- 同样，如果公司的规章制度中对此有明确规定，并且该规章制度已经过民主程序制定、公示或告知员工，那么公司也可以依据规章制度调整员工工资。
法定情形下的工资调整：
- 根据《工资支付暂行规定》第十二条，非因劳动者原因造成单位停工、停产在一个工资支付周期内的，用人单位应按劳动合同规定的标准支付劳动者工资。超过一个工资支付周期的，若劳动者提供了正常劳动，则支付给劳动者的劳动报酬不得低于当地的最低工资标准；若劳动者没有提供正常劳动，应按国家有关规定办理。在此类法定情形下，公司调整员工工资为基本工资（可能不低于最低工资标准）是合法的。
二、不合法情形
无正当理由单方面降薪：
- 如果公司无正当理由单方面将员工工资调整为基本工资，且该调整导致员工工资低于劳动合同约定的标准或低于当地最低工资标准，那么这种调整是不合法的。员工有权要求公司按照原工资标准支付工资，并可以依法向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
未与员工协商一致：
- 根据《劳动合同法》第三十五条，用人单位与劳动者协商一致，可以变更劳动合同约定的内容。变更劳动合同，应当采用书面形式。如果公司未与员工协商一致就单方面调整工资，那么这种调整是不合法的。员工有权拒绝接受调整，并可以要求公司按照原工资标准支付工资。
三、应对建议
与公司协商：
- 如果员工发现公司无正当理由单方面调整工资，首先可以尝试与公司进行协商，了解调整工资的原因和依据，并表达自己的诉求和意见。
收集证据并投诉或申请仲裁：
- 如果协商无果，员工可以收集相关证据（如劳动合同、工资条、公司规章制度等），向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求公司按照原工资标准支付工资，并可能要求公司支付经济补偿或赔偿金。
寻求法律援助：
- 如果员工在处理此类纠纷时感到困惑或无助，可以寻求专业律师的法律援助。律师可以根据具体情况为员工提供法律咨询、代理诉讼等服务，帮助员工维护自己的合法权益。
总结：员工调整为只发基本工资是否合法，需根据劳动合同、规章制度以及法定情形进行综合判断。如果公司无正当理由单方面调整工资或未与员工协商一致就进行调整，那么这种调整是不合法的。员工在面对此类情况时，应积极与公司协商、收集证据并投诉或申请仲裁，必要时寻求法律援助。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。