针对工厂自建小工程未竣工结算的情况，核心结论是：可通过协商、第三方调解、法律途径等方式解决，具体需结合工程实际情况和双方约定来选择合适方法。以下从不同角度展开说明：

1. 协商解决

• 适用情况：若双方对未结算的原因（如工程量争议、质量争议等）存在一定分歧，但仍有沟通余地，协商是首选方式。
• 操作建议：
  • 双方应整理好工程相关的所有资料，包括合同、施工图纸、变更签证、验收记录等，明确各自的权利义务。
  • 召开协商会议，就未结算的具体事项（如未完成的工程量、已完成的工程量计价、质量扣款等）进行逐一核对和讨论。
  • 达成一致后，签订书面结算协议，明确结算金额、支付时间、违约责任等条款，避免后续再次产生争议。

2. 第三方调解

• 适用情况：若双方协商不成，但又不希望直接通过法律途径解决，可考虑第三方调解。
• 操作建议：
  • 选择有资质的调解机构（如行业协会、人民调解委员会等）或邀请专业人士（如工程师、造价师等）作为调解人。
  • 调解过程中，双方应如实陈述事实，提供证据，调解人根据事实和法律规定提出调解方案。
  • 若双方接受调解方案，应签订调解协议，该协议具有法律约束力，双方应履行。

3. 法律途径

• 适用情况：若协商和调解均无法解决问题，或一方拒绝履行调解协议，可通过法律途径解决。
• 操作建议：
  • 起诉：向工程所在地或合同履行地的人民法院提起诉讼，要求对方履行结算义务或赔偿损失。起诉时需提交起诉状、证据材料等。
  • 申请仲裁：若合同中约定了仲裁条款，或双方事后达成仲裁协议，可向约定的仲裁机构申请仲裁。仲裁裁决具有终局性，对双方均有约束力。
  • 证据准备：无论选择起诉还是仲裁，均需准备充分的证据，包括合同、施工资料、沟通记录、证人证言等，以证明自己的主张。

4. 注意事项

• 时效性：注意诉讼时效和仲裁时效，避免因超过时效而丧失胜诉权。
• 合同审查：若合同中存在不明确或模糊的条款，应及时咨询专业律师，明确双方的权利义务。
• 风险防范：在未来的工程合作中，建议签订详细的书面合同，明确结算方式、时间、违约责任等条款，降低争议风险。

若您在处理此类问题时遇到具体困难或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。