公司员工多收客户更名费一般是不合法的，但具体是否合法需根据实际情况判断。以下从不同角度进行分析：
一、从合同约定角度
如果公司与客户在合同中明确约定了更名费的标准或范围，并且员工收取的更名费超出了这个约定，那么员工的行为就构成了违约。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人应当按照约定履行自己的义务，不得擅自变更或者解除合同。因此，在这种情况下，员工多收更名费是不合法的，公司应当承担违约责任，并可能面临客户的索赔。
二、从公司规章制度角度
如果公司内部有明确的规章制度，规定了更名费的收取标准和流程，并且员工违反了这些规定，多收了客户的更名费，那么员工的行为就违反了公司的规章制度。公司可以根据内部规定对员工进行相应的处罚，如警告、罚款、解除劳动合同等。同时，公司也应当承担因员工违规行为给客户造成的损失。
三、从法律法规角度
如果更名费属于不合理收费：根据《中华人民共和国价格法》等相关法律法规，经营者不得利用虚假的或者使人误解的价格手段，诱骗消费者或者其他经营者与其进行交易。如果公司员工多收的更名费属于不合理收费，即没有合法依据或超出合理范围，那么这种行为就可能构成价格欺诈或乱收费，是违法的。
如果更名费有合法依据但超出标准：即使更名费有某种合法依据（如某些特定服务或手续需要收取的费用），但如果员工收取的金额超出了规定的标准或范围，也可能构成违法。这需要根据具体的法律法规和行业标准来判断。
四、实际操作建议
公司应审查合同和规章制度：公司应当审查与客户签订的合同以及内部的规章制度，确保更名费的收取有明确的约定和规定，并且符合法律法规的要求。
加强员工培训和管理：公司应当加强对员工的培训和管理，确保员工了解并遵守合同和规章制度中关于更名费的规定，避免出现违规行为。
及时处理客户投诉：如果客户对更名费有异议或投诉，公司应当及时处理并给出合理的解释和解决方案，以维护公司的声誉和客户关系。
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