公司快要闭店时取消餐补、交通补贴和住房补贴是否合理，需分情况讨论：
若补贴属于劳动合同约定内容：
- 法律背景：根据《劳动合同法》的相关规定，劳动合同是劳动者与用人单位确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。劳动合同一旦签订，双方均应严格履行。若劳动合同中明确约定了餐补、交通补贴和住房补贴作为劳动报酬的一部分，那么这些补贴就构成了劳动者应享有的合法权益。
- 法律建议：在此情况下，公司单方面取消这些补贴，可能构成对劳动合同的变更或解除，需要与劳动者协商一致，并签订书面变更协议。若公司未经协商一致即取消补贴，劳动者有权要求公司继续履行原劳动合同，支付相应的补贴，或者以公司未足额支付劳动报酬为由，提出解除劳动合同并要求经济补偿。
若补贴属于公司福利政策：
- 法律背景：福利政策是公司为了吸引和留住人才，提高员工满意度和忠诚度而制定的一系列非强制性的待遇措施。这些政策通常不构成劳动合同的一部分，而是公司根据自身经营状况和员工需求自主决定的。
- 法律建议：在此情况下，公司有权根据自身经营状况和市场环境的变化，对福利政策进行调整或取消。但需要注意的是，公司在调整或取消福利政策时，应当遵循公平、公正、透明的原则，并提前告知员工，以便员工做出相应的安排。若公司未提前告知或调整方式不合理，可能引发员工的不满和纠纷。
若公司闭店属于不可抗力或经营困难：
- 法律背景：在特定情况下，如公司因不可抗力（如自然灾害、政策调整等）或经营困难导致闭店，可能面临无法继续履行劳动合同或支付劳动报酬的困境。
- 法律建议：在此情况下，公司应当与劳动者进行充分沟通，说明闭店的原因和后续安排，并尽量与劳动者协商达成一致。若公司确实无法继续支付补贴，且劳动者同意的，可以视为双方对劳动合同的变更。但若劳动者不同意，且公司无法提供其他合理的解决方案，劳动者有权要求公司按照劳动合同的约定支付补贴，或者通过法律途径维护自己的合法权益。
额外提醒：
- 在处理此类纠纷时，劳动者应当保留好相关证据，如劳动合同、工资条、补贴发放记录等，以便在需要时证明自己的权益。
- 若双方无法协商一致，劳动者可以向当地劳动争议调解委员会申请调解，或者向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，甚至向人民法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。
总结：公司快要闭店时取消餐补、交通补贴和住房补贴是否合理，取决于这些补贴是否属于劳动合同约定内容、公司福利政策以及公司闭店的具体原因。在处理此类问题时，建议双方保持沟通，尽量协商一致，若无法协商一致，则可以通过法律途径解决纠纷。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。