劳动仲裁一般不能直接与政府部门进行协商仲裁，但特定情况下，与政府部门下属单位产生的劳动争议可通过劳动仲裁解决。以下是详细分析：
劳动仲裁的常规适用范围
- 劳动仲裁主要解决的是劳动者与用人单位之间的劳动争议。这里的“用人单位”通常指的是企业、个体经济组织、民办非企业单位等，以及与劳动者建立劳动关系的国家机关、事业组织、社会团体。然而，政府部门作为行政机关，其与劳动者之间的关系往往不是基于劳动合同建立的劳动关系，而是基于行政法规定的其他类型的关系。因此，一般情况下，个人与政府部门之间的争议不能通过劳动仲裁来解决。
特殊情况下的劳动仲裁适用
- 如果政府部门有下属的具有独立用人资格的企事业单位，如国有企业、国有控股企业等，这些下属单位与劳动者之间发生的劳动争议是可以提交劳动仲裁机构进行裁决的。这是因为这些下属单位具有独立的法人资格和用工权，与劳动者之间建立了明确的劳动关系。在这种情况下，劳动仲裁是可以适用于与政府部门下属单位之间的劳动争议的。
与政府部门争议的其他解决途径
- 如果是个人与政府部门之间就人事关系、行政编制等事项产生的争议，这类争议通常不属于劳动仲裁的受案范围。对于这类争议，应当通过人事争议仲裁（适用于国家机关与其工作人员之间因人事关系的建立、变更、解除等发生的争议）或其他行政途径、法律程序来解决。具体来说，可以提交给相应的人事争议仲裁委员会进行仲裁，或者依法向人民法院提起诉讼。
建议：
- 在处理与政府部门的争议时，首先需要明确争议的性质和双方关系的法律基础。
- 根据具体情况选择合适的解决途径，如劳动仲裁、人事争议仲裁或法律诉讼等，以确保自身权益得到有效维护。
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