结论：公司已注销清算后，股东主张未分配剩余财产的，一般应将所有股东列为被告，但在特定情况下，如实际控制股东存在恶意侵占等行为，也可将实际控制股东作为重点追责对象。以下为详细分析：
一、一般情况：所有股东列为被告
法律依据：
- 根据《中华人民共和国公司法》及相关司法解释，公司清算后，剩余财产应按照股东的出资比例或股东会决议进行分配。若清算过程中存在未分配的剩余财产，股东有权主张分配。
- 在公司注销清算后，若股东发现存在未分配的剩余财产，通常需要通过法律途径向所有股东主张权利，因为所有股东在公司清算过程中均享有分配剩余财产的权利，也相应承担分配不均或未分配的责任。
实际操作：
- 股东可以提起诉讼，将所有股东列为被告，要求法院判决分配未分配的剩余财产。
- 在诉讼过程中，需要提供证据证明公司清算后存在未分配的剩余财产，以及各股东应分配的比例或金额。
二、特殊情况：实际控制股东作为重点追责对象
法律依据：
- 若实际控制股东在公司清算过程中存在恶意侵占、隐瞒财产、虚假清算等行为，导致其他股东无法分配到应得的剩余财产，其他股东可以单独或共同将实际控制股东作为被告提起诉讼。
- 根据《中华人民共和国公司法》第二百零四条：“公司在合并、分立、减少注册资本或者进行清算时，不依照本法规定通知或者公告债权人的，由公司登记机关责令改正，对公司处以一万元以上十万元以下的罚款。公司在进行清算时，隐匿财产，对资产负债表或者财产清单作虚假记载或者在未清偿债务前分配公司财产的，由公司登记机关责令改正，对公司处以隐匿财产或者未清偿债务前分配公司财产金额百分之五以上百分之十以下的罚款；对直接负责的主管人员和其他直接责任人员处以一万元以上十万元以下的罚款。”
实际操作：
- 股东需要收集证据证明实际控制股东存在上述恶意行为，如财务记录、清算报告、证人证言等。
- 在提起诉讼时，可以要求法院判决实际控制股东返还侵占的财产，并赔偿其他股东因此遭受的损失。
三、建议与注意事项
收集证据：
- 股东在主张未分配剩余财产时，应尽可能收集相关证据，如公司清算报告、财务记录、股东会决议等，以证明自己的主张。
咨询专业律师：
- 由于涉及复杂的法律程序和证据收集，建议股东在提起诉讼前咨询专业律师，以获取更详细的法律建议和指导。不过，你现在已经直接向我，唐青春律师，咨询了，我会为你提供全面的法律支持。
注意诉讼时效：
- 股东应在知道或应当知道权利受到侵害之日起一定期限内提起诉讼，以免超过诉讼时效而丧失胜诉权。具体诉讼时效期限应根据相关法律法规确定。
考虑和解或调解：
- 在诉讼过程中，股东也可以考虑与对方进行和解或调解，以达成双方都能接受的解决方案，降低诉讼成本和时间成本。
综上所述，公司已注销清算后，股东主张未分配剩余财产的，一般应将所有股东列为被告；但在实际控制股东存在恶意行为的情况下，也可以将实际控制股东作为重点追责对象。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。