劳务派遣中，工资由厂里（用工单位）发放的情况，通常是因为劳务派遣单位与用工单位在劳务派遣协议中约定了由用工单位代发工资，但这并不改变劳务派遣单位作为工资支付责任主体的法律地位。以下是对这一问题的详细分析：
一、劳务派遣单位作为工资支付主体的法律依据
根据《中华人民共和国劳动合同法》第五十八条，劳务派遣单位是法律意义上的用人单位，应当履行用人单位对劳动者的义务，这其中包括按月支付劳动报酬。劳务派遣单位与被派遣劳动者订立的劳动合同中，应明确载明被派遣劳动者的用工单位、派遣期限、工作岗位等情况，并需订立二年以上的固定期限劳动合同。在无工作期间，劳务派遣单位仍需按照所在地人民政府规定的最低工资标准，向被派遣劳动者按月支付报酬。
二、用工单位代发工资的特殊情况
代发约定：在实际操作中，为了便于管理和操作，劳务派遣单位和用工单位可能会在劳务派遣协议中明确约定，由用工单位直接向被派遣劳动者发放工资（如加班费、绩效奖金等）。这种代发行为并不违反法律法规的强制性规定，因此是合法的。
责任主体不变：即便工资由用工单位代发，劳务派遣单位依然是工资支付的责任主体。若出现工资支付问题，如拖欠、克扣等，被派遣劳动者有权要求劳务派遣单位承担相应法律责任。这是因为劳务派遣单位作为用人单位，与被派遣劳动者之间建立了劳动关系，应当履行用人单位对劳动者的义务。
三、实际案例分析
以某工厂通过劳务派遣公司招聘工人为例，劳务派遣公司与工人签订劳动合同，并与工厂签订劳务派遣协议。协议中约定，工人的基本工资由劳务派遣公司按月发放，而工厂则根据工人的加班情况直接支付加班费给工人。这一做法既符合法律法规的要求，又体现了实践操作中的灵活性。在这种情况下，虽然加班费由工厂直接支付，但工人的基本工资仍由劳务派遣公司负责发放，且劳务派遣公司作为工资支付的责任主体地位不变。
四、对被派遣劳动者的建议
了解劳动关系归属：作为被派遣劳动者，您有权了解自己的劳动关系归属、工资待遇以及社保缴纳情况等。这有助于您在遭遇工资问题时，明确向谁主张权益。
保留相关证据：在劳务派遣关系中，您应保留好与劳务派遣单位和用工单位签订的劳动合同、劳务派遣协议以及工资发放记录等证据。这些证据在您主张权益时将起到关键作用。
及时维权：若您遭遇工资拖欠、克扣等问题，应及时向劳务派遣单位或用工单位提出异议，并要求其纠正。若问题得不到解决，您可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
综上所述，劳务派遣中工资由厂里发放的情况通常是因为劳务派遣单位与用工单位在劳务派遣协议中约定了代发工资。但无论何种情况，劳务派遣单位始终是工资支付的责任主体。作为被派遣劳动者，您应了解自己的劳动关系归属和工资待遇情况，并在遭遇问题时及时维权。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。