医生给了三天病假，休两天并不违法。下面我来详细解释一下：

首先，病假是员工因患病或非因工负伤，需要停止工作医疗时，根据本人实际参加工作年限和在本单位工作年限，给予的医疗假期。医生给出的病假建议，通常是基于员工的病情和医疗需要来确定的。

在这个情况下，医生给出了三天的病假建议，这意味着员工有权在这三天内休息并接受治疗，而不用担心工作上的问题。如果员工选择在这三天中的两天休息，这是完全合法的，因为员工有权根据自己的身体状况和病假建议来决定何时休息。

此外，需要注意的是，病假期间员工应遵守公司的病假管理制度，如提交病假证明、履行请假手续等。同时，公司也应尊重员工的病假权利，不得无故克扣员工的病假工资或福利。

综上所述，医生给了三天病假，休两天并不违法。如果员工在病假期间遇到任何问题或纠纷，可以及时向公司人事部门或劳动监察部门反映，并寻求法律援助。当然，如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的咨询，也可以直接向我提问，我会尽力为你提供帮助。