工厂以工作能力、工作水平苛扣员工工资，这一行为通常是不合法的。以下从多个角度进行分析：

法律依据

根据《中华人民共和国劳动法》第五十条的规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这意味着，除非有明确的法律规定或合同约定，否则工厂不得随意克扣员工的工资。同时，《中华人民共和国劳动合同法》第三十条也强调，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。

合法扣减工资的情形

虽然工厂一般不得克扣员工工资，但在某些特定情况下，扣减工资可能是合法的。这些情况通常包括：

1. 代扣代缴费用：如个人所得税、社会保险费用等，这些费用是依法需要从员工工资中扣除的。
2. 赔偿经济损失：如果员工因故意或重大过失给用人单位造成经济损失，用人单位可以按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。但这种扣减通常有一定的限制，如每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地最低工资标准。
3. 违反规章制度：如果员工违反了用人单位的规章制度，且该规章制度是依法制定并公示的，用人单位可以根据规章制度对员工进行一定的经济处罚。但这种处罚也应当合理，且不得违反法律法规的强制性规定。

工厂以工作能力、工作水平苛扣工资的合法性分析

工厂以工作能力、工作水平为由苛扣员工工资，并不属于上述合法扣减工资的情形。工作能力、工作水平是员工个人素质和工作表现的体现，它们与员工的工资支付没有直接的法律依据上的关联。除非劳动合同或工厂的规章制度中明确规定了根据工作能力、工作水平调整工资的具体标准和程序，并且这些规定是依法制定并公示的，否则工厂不得以此为由克扣员工工资。

建议与措施

如果员工遇到工厂以工作能力、工作水平为由苛扣工资的情况，可以采取以下措施：

1. 与工厂协商：首先尝试与工厂进行沟通，了解扣减工资的具体原因和依据，并尝试达成和解。
2. 向劳动监察部门投诉：如果协商无果，可以向当地的劳动监察部门投诉，请求其介入调查并维护自己的合法权益。
3. 申请劳动仲裁或提起诉讼：如果劳动监察部门的处理结果不满意，还可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼，通过法律途径解决争议。

总结来说，工厂以工作能力、工作水平苛扣员工工资的行为，在缺乏明确法律依据或合同约定的情况下，是不合法的。员工在遇到此类情况时，应当积极维护自己的合法权益，通过合法途径解决争议。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。