结论前置：实习期如果三方协议里没有填写加班工资，事后发工资时提出反驳是否有用，这取决于多种因素，包括协议的具体内容、实际加班情况、以及相关法律法规的适用等。下面我将从不同角度为您详细分析。

1. 三方协议的法律效力：

   • 三方协议，通常涉及实习生、学校和用人单位三方，是确定各方权利和义务的重要文件。如果协议中未明确加班工资的相关条款，这并不意味着用人单位可以完全免除支付加班工资的责任。因为，根据《劳动法》及相关规定，劳动者（包括实习生在特定情况下）有权获得因加班而产生的额外报酬。

2. 加班工资的法律依据：

   • 即使三方协议中没有明确加班工资，如果实习生确实存在加班情况，且加班符合法律规定的条件（如用人单位安排、非自愿性等），那么实习生仍有权要求用人单位支付加班工资。这是因为，法律对于加班工资的规定是强制性的，不因双方协议未约定而免除。

3. 反驳的有效性及途径：

   • 有效性：如果实习生能够提供充分的证据证明自己存在加班情况，且加班是用人单位安排的，那么其反驳要求支付加班工资是合理的，也是有可能得到法律支持的。
   • 途径：实习生可以先与用人单位进行协商，尝试通过友好沟通解决问题。如果协商无果，可以向当地的劳动监察部门投诉，或者通过劳动仲裁、诉讼等法律途径来维护自己的合法权益。

4. 实际操作中的建议：

   • 保留证据：实习生在实习期间应尽可能保留与加班相关的证据，如加班通知、考勤记录、工作记录等，以便在需要时证明自己的加班情况。
   • 及时沟通：如果发现三方协议中未约定加班工资，或者对加班工资有疑问，应及时与用人单位沟通，明确双方的权利和义务。
   • 寻求法律帮助：如果与用人单位的沟通无果，或者遇到复杂的法律问题，建议及时咨询专业律师，以便更好地维护自己的合法权益。

进一步思考：为了避免类似纠纷的发生，建议实习生在签订三方协议前，仔细阅读协议内容，特别是关于工资福利、工作时间、加班等方面的条款。如果协议中有不明确或者不合理的地方，应及时提出并协商修改。同时，也可以考虑在协议中增加关于加班工资的具体约定，以明确双方的权利和义务。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询，我会尽我所能为您提供专业的法律建议。