关于实习协议中是否包含三倍加班费的问题，结论前置如下：

1. 若实习生与用人单位构成劳动关系：在法定节假日加班时，实习生应依法享受三倍工资待遇。
2. 若实习生与用人单位不构成劳动关系：则实习协议中是否包含三倍加班费，需依据实习协议的具体约定以及单位规章制度来确定。

详细分析如下：

一、实习生与用人单位构成劳动关系的情况

如果实习生已经与用人单位签订了劳动合同，或者虽然未签订劳动合同但实际履行了劳动权利义务，形成了事实劳动关系，那么在法定节假日加班时，实习生应依法享受三倍工资待遇。这是根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条的规定，用人单位在法定休假日安排劳动者工作的，应当支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。

举例：某实习生与公司签订了正式劳动合同，并在国庆节假日期间按公司安排加班，该实习生有权要求公司支付三倍工资。

二、实习生与用人单位不构成劳动关系的情况

如果实习生是在校学生，以学习为目的到单位进行实习，与单位之间形成的是实习关系而非劳动关系，则一般不适用《劳动法》中关于三倍工资的规定。实习主要是为了积累实践经验、完成学业任务，并非以提供劳动获取报酬为主要目的。在这种情况下，实习协议中是否包含三倍加班费，需依据实习协议的具体约定以及单位规章制度来确定。

举例：某高校学生与企业签订了实习协议，明确实习期间主要是学习和实践，企业每月给予实习补贴。若实习协议中未对法定节假日加班报酬作出约定，则该实习生不能依据《劳动法》要求企业支付三倍工资。但若实习协议中明确规定了节假日加班享受三倍工资，那么用人单位应当按照约定支付。

三、实习生的权益保护建议

1. 签订明确的实习协议：实习生在实习前应与用人单位签订明确的实习协议，明确实习内容、时间、地点、报酬及双方的权利义务，特别是关于加班工资的相关事宜。
2. 了解并维护自己的合法权益：实习生应了解相关法律法规和实习协议的内容，确保自己的合法权益得到有效保障。如遇加班工资纠纷，可首先尝试与用人单位协商解决；协商不成时，可寻求法律援助或向相关部门投诉维权。
3. 关注用人单位的规章制度：实习生应关注用人单位的规章制度，特别是关于加班报酬、工作时间等方面的规定，以便在发生纠纷时能够维护自己的合法权益。

总结：实习协议中是否包含三倍加班费，需根据实习生与用人单位之间的关系性质以及实习协议或单位规章制度的约定来确定。实习生在实习前应充分了解相关法律法规和实习协议的内容，以确保自己的合法权益得到有效保障。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。