劳务公司的工资由分包代发，在合法合规的框架下是被允许的，但需确保操作符合相关法律法规和合同约定，以避免法律风险和纠纷。以下从不同角度为您详细分析：
一、合法性基础与前提条件
法律依据：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关劳动法律法规，并未明确禁止劳务公司代发工资的行为。同时，原劳动和社会保障部制定的《工资支付暂行规定》也允许用人单位委托银行或其他单位代为发放工资。这表明，在法律层面上，劳务公司作为受托方，可以代实际用工单位发放工资。
前提条件：
- 签订委托协议：劳务公司与分包方（即实际用工单位）需签订明确的委托代发工资协议，详细约定双方权利、义务，包括代发工资的范围、标准、方式、时间等。这是确保代发行为合法合规的基础。
- 资质合规：劳务公司需具备合法的经营资质，如经过工商注册登记，取得营业执照等。如涉及到为劳动者缴纳社会保险等业务，还需在相关社保部门进行登记。
二、合法情形与操作流程
劳务派遣关系：
- 在劳务派遣关系中，劳务公司与用工单位签订劳务派遣协议，将劳动者派遣至用工单位工作。劳务公司作为用人单位，负责与劳动者签订劳动合同，并承担支付工资、缴纳社保等义务。此时，劳务公司可按照协议约定直接为被派遣劳动者代发工资。
劳务外包关系：
- 当企业将部分业务或工作外包给劳务公司时，劳务公司会组织人员完成相应工作任务。劳务公司根据与企业的外包合同约定，对参与项目的劳动者进行管理，并代发这些劳动者的工资。在此情形下，劳务公司同样需与分包方签订详细的代发工资协议。
三、注意事项与合规要求
合法合规操作：
- 代发工资必须建立在真实的劳务关系基础之上。劳务公司应确保工资计算准确无误，包括工资标准、工作时间、加班工资等各项明细都应符合法律法规和合同约定。
- 劳务公司应严格遵守财务制度和税收法规，依法代扣代缴劳动者的个人所得税等税费，并按规定为劳动者缴纳社会保险和住房公积金等。
保护劳动者权益：
- 劳务公司在代发工资过程中，应充分保护劳动者的合法权益。包括但不限于提供工资明细、保障工资的保密性、确保工资的安全和准时发放等。若劳务公司存在克扣、截留劳动者工资或未按照约定时间发放工资等行为，将严重损害劳动者的合法权益，并可能面临法律责任。
风险防控：
- 劳务公司应谨慎处理代发工资事宜，确保合法合规地提供代发工资服务。若遇任何疑问或需要进一步了解相关法律法规，应及时向我咨询，以避免可能的纠纷和法律风险。
四、可能涉及违法的情形
未取得资质：
- 劳务公司若未取得相应资质而从事代发工资业务，将面临违法风险。
侵犯劳动者权益：
- 如前所述，克扣、截留劳动者工资或未按照约定时间发放工资等行为，均属于违法行为。
协助逃避法律责任：
- 如果劳务公司明知分包方存在逃避缴纳社会保险、少缴税款、规避劳动法律法规规定的义务等违法意图，仍然协助其进行代发工资操作，那么劳务公司和分包方都将面临法律责任。
总结来说，劳务公司的工资由分包代发，在符合相关法律法规、具备相应资质、确保工资安全准时发放并保护劳动者权益的前提下，是合法的。但务必确保整个过程的合法合规性，以维护劳动者的合法权益，避免可能的纠纷和法律风险。若您在此过程中遇到任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。