结论前置：在合同争议中，擅自扣留对方财产的行为是否违法，需根据具体情况判断，一般情况下，擅自扣留对方财产属于违法行为，可能构成侵权或违反合同约定。以下从不同角度进行分析：

一、从侵权责任角度分析

根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，任何组织或者个人不得以侵占、哄抢、破坏等方式侵害他人的财产权益。在合同争议中，如果一方擅自扣留对方的财产，且该财产并非双方争议的标的物，或者即使属于争议标的物，但未经法律程序（如诉讼保全、仲裁保全等）或双方约定，擅自扣留的行为很可能构成对对方财产权的侵害，需承担侵权责任。

举例说明：假设甲乙双方签订了一份买卖合同，甲方向乙方购买一批货物。后因合同履行问题发生争议，甲方在未与乙方协商且未通过法律程序的情况下，擅自扣留了乙方的一批其他非争议货物。此时，甲方的行为就构成了对乙方财产权的侵害，乙方有权要求甲方返还货物并赔偿损失。

二、从合同约定角度分析

如果合同中明确约定了争议解决方式及财产保全措施，且一方在争议发生后按照合同约定采取了合理的保全措施（如双方协商一致后由一方暂时保管争议财产），则该行为可能不构成违法。但这种约定必须明确、合法，且不得违反法律、行政法规的强制性规定。

举例说明：甲乙双方在合同中约定，如发生争议，双方应首先协商解决；协商不成的，任何一方均有权要求将争议财产交由第三方保管，直至争议解决。后因合同履行问题发生争议，甲方按照合同约定，与乙方协商后，将争议财产交由双方共同认可的第三方保管。此时，甲方的行为就不构成违法。

三、从法律程序角度分析

在合同争议中，如果一方认为对方的财产与争议有关，且担心对方转移、隐匿或毁损财产，应当通过法律程序（如向法院申请诉讼保全、向仲裁机构申请仲裁保全等）来保全财产。未经法律程序擅自扣留对方财产的行为，不仅可能构成侵权，还可能因妨碍民事诉讼或仲裁而被司法机关处罚。

举例说明：甲乙双方因合同履行问题发生争议，甲方认为乙方可能转移争议财产，于是未经法院或仲裁机构许可，擅自扣留了乙方的部分财产。后乙方向法院提起诉讼，并申请法院对甲方的扣留行为进行审查。法院经审查认为，甲方的扣留行为未经法律程序许可，构成妨碍民事诉讼的行为，于是对甲方进行了处罚。

法律建议

1. 在合同争议中，应尽量避免擅自扣留对方财产。如认为对方的财产与争议有关，且担心对方转移、隐匿或毁损财产，应当通过法律程序来保全财产。
2. 在签订合同时，应明确约定争议解决方式及财产保全措施。这样可以在争议发生时，按照合同约定采取合理的保全措施，避免不必要的法律纠纷。
3. 如已擅自扣留对方财产，应尽快与对方协商解决，或通过法律程序来确认扣留行为的合法性。如确认扣留行为违法，应立即返还财产并赔偿损失。

如有具体法律问题，可直接向我咨询，我将结合你的具体情况，提供更详细的法律建议。