结论：女方出轨聊天记录被删，一般情况下不能直接申请法院调取，但在特定条件下可通过合法途径尝试获取。以下分情况详细说明：
聊天记录的存储主体与性质
- 若聊天记录存储在女方个人设备（如手机、电脑）中且已被删除，由于个人设备中的数据属于个人隐私范畴，法院通常不会主动介入调取。此时，若想获取这些记录，需考虑是否有其他合法途径，例如女方自愿提供，或者通过技术手段恢复（但需注意，非法获取他人隐私信息可能涉及侵权甚至违法）。
- 若聊天记录存储在第三方平台（如微信服务器），根据相关法律法规及平台规定，平台有义务保护用户隐私，不会随意向个人或法院提供用户聊天记录。但在涉及刑事案件或重大民事纠纷，且符合法定条件时，法院可能依法向平台发出协助调查通知书，要求平台提供相关记录。不过，出轨行为一般不属于刑事案件，除非伴随有重婚、诈骗等犯罪行为。
申请法院调取的法定条件
- 申请法院调取证据需满足一定条件，即该证据对于案件事实的查明具有关键作用，且申请人无法自行获取。在出轨纠纷中，若聊天记录是证明出轨行为的关键证据，且申请人确实无法通过其他途径获取（如女方拒绝提供，且无法通过技术手段恢复），此时可尝试向法院申请调取。但需注意，法院是否同意调取，需根据案件具体情况及法律规定综合判断。
实际操作中的难点与建议
- 在实际操作中，申请法院调取已删除的聊天记录存在较大难度。一方面，已删除的记录可能无法完全恢复；另一方面，即使能够恢复，也可能因涉及隐私保护问题而难以被法院采纳。因此，建议当事人在收集证据时，尽量通过合法途径获取其他形式的证据，如证人证言、照片、视频等，以形成完整的证据链。
- 若确实需要聊天记录作为证据，且其他途径无法获取，可考虑在起诉前或诉讼过程中，与女方进行协商，看是否能够达成和解或调解协议，在协议中明确出轨事实及责任承担等问题。这样既能避免直接申请调取聊天记录的尴尬和难度，又能有效解决纠纷。
总结：女方出轨聊天记录被删后，直接申请法院调取存在较大难度。建议当事人通过合法途径获取其他形式的证据，或在必要时与女方协商解决纠纷。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。