就业协议书使用电子章是可以的。从实际操作的角度看，电子就业协议书已经逐渐成为主流，特别是在某些地区，如广东省，从2020届毕业生开始就已经推行使用电子就业协议书。这种电子形式的就业协议书具有与纸质协议书同等的法律效力，并且更加便捷高效。

在电子就业协议书的签订过程中，用人单位和毕业生双方可以通过电子签章的方式完成协议的签署。这种电子签章通常是通过特定的平台或小程序实现的，如“广东大学生就业创业”微信小程序等。在这些平台上，毕业生可以填写就业协议的相关信息，并等待用人单位的审核和签章。一旦用人单位完成签章，并同意协议内容，无论毕业生是否上传系统加盖学校电子签章，协议书都已经生效。这是因为用人单位与毕业生是签约双方，学校只是作为鉴证登记方，目的是作为毕业生就业方案的依据。

因此，如果你正在面临签订就业协议书的情况，并且你的用人单位或学校提供了电子签章的方式，你可以放心地使用电子章来完成协议的签署。当然，在签署之前，请务必仔细核对协议内容，确保所有信息都是准确无误的。