结论：当公司账户被查封时，一般情况下不能通过该账户直接发放员工工资，但企业可以通过合法途径和积极沟通来妥善解决工资发放问题。
一、账户查封对工资发放的影响
当公司基本账户被查封或冻结后，该账户的资金使用将受到法律的严格限制。通常情况下，这种限制仅限于特定的、符合法律规定的资金收支活动，如执行法院判决的支付等。而正常的工资发放支出，由于不属于这些特定活动，因此往往不能通过被查封的账户进行。
二、合法解决途径
申请解封或解冻部分资金用于发工资
- 企业可以向查封或冻结账户的相关司法机关（如法院）提出正式申请，详细说明需要支付员工工资以保障员工基本生活、维持企业正常运营等合理理由。
- 司法机关将依据具体情况进行审查和判断，若认为申请合理且符合法律规定，可能会同意解封或解冻账户内相应额度的资金，专用于发放工资。
利用其他账户或支付方式发放工资
- 如果企业还拥有其他合法的银行账户（如一般账户），且这些账户未被查封或冻结，那么可以通过这些账户来发放员工工资。
- 此外，企业也可以考虑使用第三方支付平台（如支付宝企业账户、微信企业支付等）等合法合规的支付方式来完成工资的发放。
现金发放
- 根据银行现金管理规定，企业可以合法提取备用金用于工资发放。
- 企业可以组织现场发放，准备工资清单，让员工签字确认，并做好财务记录，以确保工资发放的透明度和合法性。
实行暂缓支付或委托代发
- 若冻结期限未超30日，企业可以通过员工大会征求意见，实现工资暂缓支付，但延期不得超过30个自然日。
- 若超出30日，企业需与员工协商并达成共识后方可延长支付。
- 企业还可以考虑委托劳务公司代为发放工资，以确保工资能够及时、准确地到达员工账户。
三、法律建议与注意事项
- 及时沟通：企业应第一时间与员工沟通账户冻结情况及工资发放安排，避免员工恐慌和误解。
- 遵守法规：在采取任何措施前，企业应确保所有操作符合相关法律法规，特别是《中华人民共和国劳动合同法》及《工资支付暂行规定》等。
- 积极寻求法律援助：如果企业在处理账户查封和工资发放问题时遇到困难，可以积极寻求法律援助，以了解冻结原因并尽快解决问题。
四、可能面临的法律后果
- 如果企业未能按时支付员工工资，可能会面临员工投诉、劳动仲裁等法律风险。
- 在极端情况下，如果企业长期拖欠工资且拒不改正，还可能面临行政处罚或刑事责任。
五、预防措施
- 企业应加强内部管理，确保财务运作的稳健性，预防类似账户查封情况的发生。
- 企业可以建立应急预案，以应对可能出现的账户查封等突发情况，确保员工工资的按时支付和企业的正常运营。
综上所述，虽然公司账户被查封会给工资发放带来困难，但通过合法途径和积极沟通，企业仍有可能妥善解决这一问题。如果您在处理此类问题时遇到任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。