关于公民申请查看行政许可申请书并询问能否复印以及是否需要签署保密协议的问题，这主要取决于该行政许可申请书是否涉及国家秘密或敏感信息。以下是根据相关保密法规和常规做法给出的详细解答：
一、关于复印行政许可申请书
非涉密文件：如果行政许可申请书不涉及国家秘密或敏感信息，那么公民在申请查看后，通常是可以复印的。这种情况下，复印行为不会对国家安全或公共利益造成损害。
涉密文件：如果行政许可申请书涉及国家秘密（如绝密级、机密级或秘密级文件），那么复印行为将受到严格限制。根据保密法及其实施条例的规定，绝密级文件非经原确定密级的机关单位或者上级机关批准，不得复制和摘抄；机密级和秘密级文件的复制也必须经过批准并履行审批手续。因此，在这种情况下，公民需要向相关机关提出申请，并经过批准后才能进行复印。
二、关于签署保密协议
非涉密文件：对于不涉及国家秘密的行政许可申请书，公民在复印时通常不需要签署保密协议。因为这类文件不包含敏感信息，复印行为不会对国家安全或公共利益构成威胁。
涉密文件：如果行政许可申请书涉及国家秘密，那么公民在申请复印时，相关机关可能会要求签署保密协议。保密协议是确保公民在复印、使用或传播涉密文件时遵守保密规定的重要手段。通过签署保密协议，公民承诺不泄露文件中的敏感信息，从而保护国家安全或公共利益。
三、建议与注意事项
提前咨询：在申请查看行政许可申请书并计划复印之前，建议公民先向相关机关咨询该文件是否涉及国家秘密或敏感信息，以及复印是否需要批准和签署保密协议。
遵守规定：如果文件涉及国家秘密或敏感信息，公民应严格遵守相关保密法规和规定，按照要求申请批准并签署保密协议（如需）。
保护信息安全：无论文件是否涉及国家秘密，公民在复印和使用过程中都应妥善保管文件，防止信息泄露或被不当使用。
综上所述，公民在申请查看行政许可申请书并计划复印时，应根据文件是否涉及国家秘密或敏感信息来决定是否需要批准和签署保密协议。如有任何疑问或不确定之处，建议提前咨询相关机关以获取准确指导。