协议双方盖章不在一张纸上，只要协议内容完整、双方意思表示真实且不违反法律法规的强制性规定，该协议仍然是有效的。以下从不同角度为你详细分析：

协议效力的核心要素

协议的效力主要取决于以下几个核心要素：

1. 双方意思表示真实：即协议是双方自愿、平等、协商一致的结果，不存在欺诈、胁迫等情形。
2. 协议内容合法：协议内容不得违反法律法规的强制性规定，不得损害国家、集体或第三人的利益。
3. 协议形式符合法律规定：虽然盖章是协议形式的一种重要表现，但并非唯一形式。在法律上，协议的形式可以包括书面、口头或其他形式，只要能够证明双方的意思表示即可。对于书面协议，盖章是确认双方身份和意思表示的一种常见方式，但并非绝对必要。

盖章不在一张纸上的情况分析

1. 盖章作为确认手段：盖章的主要作用是确认协议的真实性和双方的身份。如果双方已经在协议的其他部分（如正文、签名页等）明确表达了各自的意思，并且盖章只是作为对这种意思表示的进一步确认，那么盖章不在一张纸上并不会影响协议的效力。
2. 协议内容的完整性：关键在于协议的内容是否完整、清晰，并且双方对协议的内容没有异议。如果盖章的纸张只是协议的一部分，而协议的主要内容（如权利义务、违约责任等）都明确记载在其他纸张上，并且双方对这些内容没有争议，那么盖章不在一张纸上同样不会影响协议的效力。
3. 实际操作中的注意事项：为了避免因盖章不在一张纸上而引发的纠纷，双方在签订协议时可以采取一些措施，如：在协议中明确说明盖章的纸张是协议的一部分；在盖章的纸张上注明协议的名称、编号等信息，以便与协议的其他部分相对应；在签订协议时，双方可以共同确认协议的所有内容，并确保盖章的纸张与协议的其他部分一起构成完整的协议。

可能的法律后果

如果协议双方盖章不在一张纸上，但协议内容完整、双方意思表示真实且不违反法律法规的强制性规定，那么该协议仍然具有法律效力。然而，如果因盖章不在一张纸上而导致协议内容存在歧义或争议，或者一方以此为由主张协议无效或撤销协议，那么可能需要通过法律途径来解决纠纷。在这种情况下，法院或仲裁机构会根据协议的具体内容、双方的意思表示以及相关法律法规的规定来综合判断协议的效力。

建议：在签订协议时，双方应尽可能确保协议的形式和内容都符合法律法规的规定，以避免因形式上的瑕疵而影响协议的效力。如果对协议的效力或签订过程有任何疑问，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律建议。