在共同犯罪案件中，若各被告人选择的适用程序不一致，需根据案件具体情况，结合刑事诉讼法的相关规定，分别处理以确保程序公正与效率。以下是具体分析：

1. 程序选择的基本原则
   根据《刑事诉讼法》及相关司法解释，共同犯罪案件原则上应适用同一诉讼程序（如普通程序或简易程序），但若各被告人认罪态度、案件事实清晰度等存在差异，可分别适用不同程序。核心前提是：程序选择不得损害被告人的诉讼权利，且需保障案件整体公正性。

2. 分情况处理规则

   • 部分被告人适用简易程序，部分适用普通程序
     若部分被告人认罪且案件事实清楚，可对其适用简易程序；其他被告人不认罪或案件存在争议，则对其适用普通程序。此时需注意：
     （1）法院需分别审理，但可合并开庭（如简易程序与普通程序分阶段进行）；
     （2）简易程序部分需确保被告人自愿认罪且知悉法律后果；
     （3）普通程序部分需充分保障被告人的质证、辩论等权利。
     
   • 部分被告人适用速裁程序，部分适用其他程序
     根据《刑事诉讼法》第222条，速裁程序适用于基层法院管辖、可能判处三年以下有期徒刑且被告人认罪认罚的案件。若共同犯罪中仅部分被告人符合速裁条件，可对其单独适用速裁程序，其他被告人适用简易程序或普通程序。关键点：
     （1）速裁程序需经被告人同意，且法院需审查是否符合条件；
     （2）速裁程序审理期限更短（一般10日内审结），但被告人仍享有最后陈述权。
     
   • 程序转换的特殊情形
     若审理中发现部分被告人不符合原适用程序条件（如简易程序中被告人翻供），法院应将该部分案件转为普通程序审理，其他被告人可继续适用原程序。此时需注意：
     （1）程序转换需及时通知被告人及辩护人；
     （2）已进行的诉讼行为（如证据调查）在转换后仍有效，但需根据新程序补充必要环节。

3. 实务建议

   • 对被告人：若案件涉及共同犯罪，需在认罪认罚前充分评估程序选择对自身权益的影响（如简易程序可能缩短审理周期但减少辩论机会）；
     
   • 对辩护人：需根据各被告人的案件事实、认罪态度等，协助其选择最有利的程序，并在审理中关注程序衔接问题（如证据共享、辩论权保障）；
     
   • 对法院：需严格审查程序适用条件，避免因程序差异导致“同案不同判”，同时通过合并审理等方式提高效率。

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