应当分别起诉的案件而共同起诉的，法院通常不会直接受理，已受理的可能会要求原告分别起诉或按撤诉处理，但存在例外情形。以下是对此问题的详细分析：
一、法院通常的处理方式
不予受理或驳回起诉：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，起诉应当符合一定的条件，其中包括“有明确的被告”以及“属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉人民法院管辖”。对于应当分别起诉的案件而共同起诉的，由于可能涉及多个独立的法律关系或诉讼请求，法院可能会认为不符合起诉条件，从而不予受理或驳回起诉。
要求原告分别起诉：
- 如果法院已经受理了共同起诉的案件，但在审理过程中发现应当分别起诉的，法院可能会向原告释明，要求其分别起诉。这是为了确保每个案件都能得到独立、公正的审理，避免混淆不同的法律关系和诉讼请求。
按撤诉处理：
- 在某些情况下，如果原告在法院要求分别起诉后，仍然坚持共同起诉且拒绝修改起诉状或补充相关材料的，法院可能会按撤诉处理。
二、例外情形
共同诉讼的适用：
- 虽然大多数情况下应当分别起诉的案件不能共同起诉，但如果存在共同诉讼的情形，如必要共同诉讼或普通共同诉讼，则原告可以选择共同起诉。必要共同诉讼是指当事人一方或双方为两人以上，诉讼标的是共同的，必须共同进行诉讼的案件。普通共同诉讼则是指当事人一方或双方为两人以上，诉讼标的属于同一种类，人民法院认为可以合并审理并经当事人同意的案件。
法院的裁量权：
- 在某些特殊情况下，法院可能会根据案件的具体情况，行使裁量权，允许原告共同起诉。这通常发生在案件之间存在紧密联系，且共同起诉有利于查明事实、提高诉讼效率的情况下。
三、建议
- 仔细分析案件性质：在决定是否共同起诉前，原告应仔细分析案件的性质和法律关系，确定是否存在共同诉讼的情形。
- 咨询专业律师：如果原告对案件的性质和法律关系存在疑问，或者不确定是否可以共同起诉，可以向我咨询，我会根据案件的具体情况提供专业的法律意见。
- 遵循法院指导：如果法院要求原告分别起诉或按撤诉处理，原告应遵循法院的指导，及时修改起诉状或补充相关材料，以确保案件的顺利审理。