针对您提出的“跨市搬迁员工不愿意去公司如何赔偿”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
一、核心结论
当公司跨市搬迁，且这一变化导致劳动合同无法继续履行，同时双方未能就变更劳动合同内容（如调整工作地点）达成一致时，公司在解除劳动合同时，应向不愿随迁的员工支付经济补偿。
二、法律依据与赔偿原则
根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，公司跨市搬迁属于劳动合同订立时所依据的客观情况发生重大变化。若因此导致劳动合同无法履行，且双方协商未果，公司有权解除劳动合同，但需支付经济补偿。这一原则体现了法律对劳动者权益的保护，也要求公司在做出重大决策时充分考虑员工的利益。
三、经济补偿的具体计算方式
基本标准：经济补偿按劳动者在本单位工作的年限计算，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资的经济补偿。
月工资定义：月工资是指劳动者在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资，包括基本工资、奖金、津贴等所有货币性收入。
最高限额：若劳动者的月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，经济补偿标准按职工月平均工资三倍的数额支付，且支付年限最高不超过十二年。
四、特殊情况下的赔偿处理
劳动合同明确约定工作地点：若合同中明确约定了工作地点，且公司未经员工同意擅自搬迁至其他城市，员工有权直接解除劳动合同并要求经济补偿，赔偿标准按上述工作年限计算。
公司采取合理弥补措施：如果公司采取了合理的弥补措施，如提供交通补贴、安排班车接送等，能够在一定程度上降低搬迁对员工的不利影响，使劳动合同仍可继续履行。若员工无正当理由拒绝前往，公司可能无需支付经济补偿。
劳动合同未明确约定工作地点：若合同未明确约定工作地点，或虽有约定但搬迁在合理范围内（但跨市搬迁通常不被视为合理范围），员工拒绝前往的，公司虽无需支付因搬迁本身导致的经济补偿，但仍应与员工协商变更劳动合同；协商不成的，可按照法定程序解除劳动合同并支付经济补偿。
五、员工维权建议
了解权益：员工应充分了解自己的合法权益，包括经济补偿的计算方式、赔偿范围等。
积极协商：与公司进行积极沟通协商，争取最有利的解决方案，如调整工作岗位、提供交通补贴等。
保留证据：务必保留好相关证据，如劳动合同、搬迁通知、工资条、协商记录等，以便在必要时通过法律途径维护自己的权益。
寻求法律援助：若公司拒绝支付经济补偿或协商无果，员工可以向劳动监察部门投诉，或申请劳动仲裁，甚至提起诉讼来维护自己的合法权益。
综上所述，跨市搬迁员工不愿意去公司时，公司应根据具体情况支付相应的经济补偿。员工在面对此类情况时，应了解自己的权益，积极与公司协商，并保留好相关证据以便维权。