非法持有枪支罪不起诉的理由，主要可以从以下几个方面进行考虑：

1. 不符合立案追诉标准：

   • 根据《最高人民检察院、公安部关于公安机关管辖的刑事案件立案追诉标准的规定（一）》，非法持有、私藏枪支弹药需要达到一定的数量或造成一定的危害后果才构成犯罪。如果非法持有的枪支数量未达到立案标准，或者虽然持有但未造成任何实际危害后果，那么可能不构成犯罪，从而不起诉。具体来说，非法持有、私藏军用枪支一支及以上，或以火药为动力发射枪弹的非军用枪支一支及以上，或以压缩气体等为动力的其他非军用枪支两支及以上，或军用子弹二十发以上、气枪铅弹一千发以上或其他非军用子弹二百发以上，或手榴弹、炸弹等具有严重杀伤性的弹药一枚及以上，才构成犯罪。若未达到这些标准，且未造成实际危害，则可能不起诉。

2. 存在法定不起诉情形：

   • 根据《刑事诉讼法》的相关规定，存在一些法定不起诉的情形，如犯罪嫌疑人已死亡、犯罪已过追诉时效期限、经特赦令免除刑罚、依照刑法告诉才处理的犯罪没有告诉或撤回告诉、犯罪嫌疑人、被告人真诚悔罪并赔偿损失取得被害人谅解且双方当事人达成和解协议等。如果非法持有枪支罪的犯罪嫌疑人符合这些情形之一，那么检察机关可能会作出不起诉决定。

3. 证据不足或证据存疑：

   • 在刑事诉讼中，证据是认定犯罪事实的基础。如果检察机关认为证据不足或证据存疑，无法形成完整的证据链来证明犯罪嫌疑人的罪行，那么可能会作出不起诉决定。这包括证据收集程序违法、证据内容不真实、证据之间存在矛盾等情况。

4. 犯罪情节轻微且社会危害性不大：

   • 在某些情况下，即使犯罪嫌疑人非法持有了枪支，但如果其犯罪情节轻微且社会危害性不大，检察机关也可能会考虑不起诉。这通常涉及到犯罪嫌疑人的主观恶性、犯罪动机、犯罪手段、犯罪后的表现等因素。例如，如果犯罪嫌疑人是因为好奇或误购而非法持有枪支，且未造成任何实际危害后果，那么检察机关可能会认为其社会危害性不大而作出不起诉决定。

法律建议：

• 如果您或您身边的人涉嫌非法持有枪支罪，建议尽快咨询专业律师，了解具体的法律情况和可能的辩护策略。
• 在面对检察机关的调查和审查起诉时，应积极配合并提供相关证据和材料，以证明自己的无罪或罪轻情节。
• 如果认为检察机关的起诉决定存在错误或不当之处，可以依法提出申诉或申请复议。

可能后果：

• 如果检察机关决定起诉，犯罪嫌疑人将面临刑事审判和可能的刑罚处罚。
• 如果检察机关作出不起诉决定，犯罪嫌疑人将不会被追究刑事责任，但可能会面临行政处罚或其他非刑事处罚措施。

总之，非法持有枪支罪不起诉的理由多种多样，具体取决于案件的具体情况和证据情况。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。