合同按次支付是合法的。在合同法律关系中，支付方式通常由合同双方当事人自行约定，只要该约定不违反法律法规的强制性规定，不违背公序良俗，就是有效的。以下是对这一问题的详细分析：
一、合同支付方式的自主性
根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同是民事主体之间设立、变更、终止民事法律关系的协议。合同的内容由当事人约定，一般包括当事人的姓名或者名称和住所、标的、数量、质量、价款或者报酬、履行期限、地点和方式、违约责任、解决争议的方法等条款。其中，支付方式作为合同履行的一部分，自然也是可以由当事人自主约定的。
二、按次支付的合法性
不违反法律法规：按次支付作为一种支付方式，并不违反任何法律法规的强制性规定。只要合同双方当事人在平等、自愿、公平、诚实信用的基础上达成一致，就可以选择按次支付作为合同的履行方式。
不违背公序良俗：按次支付也不违背公序良俗。公序良俗是指民事主体的行为应当遵守公共秩序，符合善良风俗，不得违反国家的公共秩序和社会的一般道德。按次支付作为一种常见的支付方式，在商业活动中被广泛接受，并不违背公序良俗。
三、按次支付的实际应用
在实际操作中，按次支付通常适用于那些需要分期履行或者按照特定次数进行支付的合同。例如，一些服务合同、租赁合同等，可能会约定按照服务次数或者租赁次数来支付费用。这种支付方式有助于明确双方的权利义务，减少纠纷的发生。
四、注意事项
虽然按次支付是合法的，但合同双方当事人在约定时仍需注意以下几点：
明确支付次数和金额：在合同中应明确约定支付的次数和每次支付的金额，以避免产生歧义和纠纷。
约定支付时间和方式：除了支付次数和金额外，还应约定支付的时间和方式，如支付日期、支付账户等，以确保支付的顺利进行。
考虑违约责任：在合同中应约定违约责任条款，以明确一方违约时应承担的责任和后果，从而保障合同的履行。
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