档案丢失是提起民事诉讼还是行政诉讼，需根据档案丢失的具体情况来判断，特别是要关注档案丢失是否与行政机关的行政行为有关，以及这种丢失是否对当事人的合法权益产生了实际影响。以下是对此问题的详细分析：
可以提起行政诉讼的情况
行政机关具体行政行为导致档案丢失：
- 如果档案是由政府机关、事业单位等具有行政管理职能的机构在管理过程中因保管不当、违规操作或违法销毁等原因丢失，且这种丢失侵犯了当事人的合法权益，如影响就业、社保、退休等权益的实现，当事人可以依法对该行政机关提起行政诉讼。例如，公立学校在学籍管理等方面依法履行公共管理职责，其对学生档案的管理行为可能被视为行使行政职权的行为，若因学校过失导致学生档案丢失，学生可考虑提起行政诉讼。
- 在此类情况下，当事人需证明行政机关的行为与其权益受损之间存在因果关系，并准备好充分的证据来支持其主张，如档案丢失的证明、因档案丢失导致的具体损失证明等。
行政机关违法行为造成的损害：
- 行政机关在没有遵循法定程序的情况下，违法处理（如销毁）相关档案，若当事人认为该行为侵害了自身合法权益，有权向法院提起行政诉讼，要求行政机关承担相应责任，包括赔偿损失和采取补救措施等。
不能提起行政诉讼的情况
非行政机关保管主体：
- 如果档案是由企业、社会团体等非行政机关保管并丢失的，这种情况通常不属于行政诉讼的受案范围。例如，私立学校因过失导致学生档案丢失，学生应通过民事诉讼或其他途径来寻求救济，如要求私立学校承担民事赔偿责任。
历史遗留问题：
- 对于因特定历史时期政策、体制等复杂因素导致的档案丢失问题，且已有特定解决途径或政策安排的，法院可能不按照行政诉讼案件受理。这类情况需要依据相关政策或规定进行处理。
诉讼前的建议
- 尝试协商与调解：在提起行政诉讼之前，建议当事人先尝试通过协商、调解等更为温和的方式解决问题，这有助于节省时间和成本，也可能达到更和谐的解决方案。例如，与档案保管机构沟通，尝试找回档案或达成赔偿协议。
- 收集证据：无论选择何种诉讼途径，当事人都应充分准备证据材料，以支持自己的主张。这包括档案丢失的证明、因档案丢失导致的具体损失证明、与档案保管机构的沟通记录等。
综上所述，档案丢失能否提起行政诉讼取决于具体情况。在决定提起诉讼前，当事人应充分了解相关法律法规和政策规定，并准备好充分的证据来支持其主张。若您在此方面遇到法律问题，可以直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供详细的法律建议和帮助。