针对您提出的“行政诉讼中单位遗失档案怎么处理”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，当单位遗失档案时，这确实是一个需要严肃对待的问题，因为档案对于个人而言往往具有极其重要的价值，可能涉及到工作经历、学历证明、职称评定等多个方面。

一、单位应采取的初步措施

1. 开具就业关系证明： 在档案遗失的情况下，单位首先可以为当事人开具就业关系证明，以证明当事人与该单位之间的劳动关系。这份证明虽然不能完全替代原始档案，但可以在一定程度上为当事人提供便利。

二、法律途径与赔偿

1. 档案保管协议与诉讼： 如果当事人与单位签署了档案保管协议，并且单位因过失导致档案遗失，那么当事人有权向法院提起诉讼，主张用人单位赔偿因其过失所致的经济损失。这是基于合同法和档案法的相关规定，单位有义务妥善保管档案，若因保管不善导致档案遗失，应承担相应的法律责任。

2. 法律依据： 根据《档案法》第四十八条的规定，单位如果丢失属于国家所有的档案，将由县级以上档案主管部门、有关机关对直接负责的主管人员和其他直接责任人员依法给予处分。这一条款明确了单位在档案保管方面的法律责任，也为当事人提供了法律上的支持。

三、建议与预防措施

1. 加强档案管理： 对于单位而言，应加强对档案的管理，建立完善的档案保管制度，确保档案的安全和完整。这包括定期对档案进行盘点、检查，以及采取必要的防火、防盗、防潮等措施。

2. 及时补救与沟通： 一旦发现档案遗失，单位应立即采取补救措施，如尝试找回档案、为当事人开具相关证明等，并与当事人进行及时沟通，说明情况并协商解决方案。

综上所述，当单位在行政诉讼中遗失档案时，应首先为当事人开具就业关系证明，并根据档案保管协议和法律规定承担相应的法律责任。同时，单位也应加强档案管理，预防类似事件的发生。希望这些解答能对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的法律建议，请随时咨询。