在仲裁子公司时，是否可以将总公司一并列为被申请人，需根据具体情况来判断。以下是对此问题的详细分析：
一、子公司与总公司的法律地位
- 子公司：根据《中华人民共和国公司法》第十三条，子公司具有法人资格，依法独立承担民事责任。这意味着子公司在法律上是独立的实体，其债务和责任通常由其自身承担。
- 总公司：总公司是设立子公司的法人实体，对子公司的行为及其产生的民事责任，在一般情况下不直接承担，除非存在特定的法律关系或行为关联。
二、可以将总公司列为被申请人的情形
总公司对子公司债务提供担保：
- 如果总公司为子公司的债务提供了担保，那么在子公司无法履行债务时，总公司作为担保人，可以被一并列为被申请人，承担相应的担保责任。
基于同一法律关系且总公司与纠纷存在实质关联：
- 若总公司在相关纠纷中与子公司基于同一法律关系存在不可分割的联系（如总公司直接干预、指示子公司行为或共同实施导致纠纷的行为），将总公司列为被申请人是合理的。例如，在合同纠纷中，若子公司签订合同但总公司实际参与谈判、制定条款并直接下达指令导致违约，申请人可将总公司和子公司一并列为被申请人。
三、不可以将总公司列为被申请人的情形
- 子公司能够独立承担责任且总公司无关联行为：
- 若子公司有足够的财产和能力独立承担民事责任，且总公司未参与到与纠纷相关的具体事务中，没有对子公司的行为进行干预或指示，则通常不需将总公司列为被申请人。例如，子公司在经营过程中与供应商签订采购合同后未能按时支付货款，但子公司有独立财产足以支付货款及违约金，且总公司对此无任何参与或干预，此时供应商只需将子公司列为被申请人即可。
四、特殊情况与仲裁协议的约束力
- 特殊情况：若总公司能提供充分证据证明子公司的债务是其自主经营、自负盈亏且与总公司财务状况独立核算的，总公司可能会减轻或免除责任。
- 仲裁协议的约束力：关于子公司签署的仲裁协议是否约束总公司，这通常取决于仲裁协议的具体内容以及仲裁机构和法院的观点。一些仲裁机构和法院可能认为，由于子公司民事责任独立，因此仲裁协议仅对子公司具有约束力；而另一些则可能认为，在特定情况下，仲裁协议也可能对总公司产生约束力。这需要根据具体案件和仲裁机构的规定来判断。
五、建议与总结
在仲裁子公司时，是否将总公司一并列为被申请人需根据具体法律关系和事实情况来确定。如果涉及复杂的法律关系或存在不确定性，建议你直接向我咨询，以便获取更准确的法律意见。同时，在签署任何合同或协议时，也建议明确约定争议解决方式和责任承担主体，以减少未来可能出现的纠纷和不确定性。