付给司机的运费一般不可以算作发工资，这主要基于以下几点分析：

1. 法律性质不同：

   • 运费：是承运人（司机）根据运输合同，为托运人（雇主或货主）完成货物运输任务后，应得的报酬。它属于运输服务费用的范畴，与运输服务的提供直接相关。
   • 工资：是雇主支付给员工的，作为员工提供劳动的报酬。工资通常与员工的工作时间、工作量、职位等因素相关，并受到劳动法的保护。

2. 合同关系不同：

   • 运费支付通常基于运输合同，该合同明确了承运人和托运人之间的权利和义务，包括运输的货物、路线、时间、费用等。
   • 工资支付则基于劳动合同，该合同规定了雇主和员工之间的劳动关系，包括工作内容、工作时间、工资待遇、社会保险等。

3. 税务处理不同：

   • 运费作为运输服务费用，通常按照增值税等相关税法规定进行税务处理。
   • 工资则作为个人所得税的应税项目，按照个人所得税法规定进行申报和缴纳。

4. 实际操作中的区分：

   • 如果司机是独立承运人，与雇主签订的是运输合同，那么支付的费用应明确为运费，而非工资。
   • 如果司机是雇主的员工，负责驾驶公司的车辆进行货物运输，那么其收入应作为工资支付，并受到劳动法的保护。在这种情况下，即使部分收入与运输任务相关，也应纳入工资范畴进行管理和税务处理。