结论：乙方在特定条件下可以要回租金，具体能否要回需结合实际情况判断。以下从不同角度进行分析：
一、合同效力角度
合同有效情形：
- 若甲乙双方签订的旅居协议是双方真实意思表示，且内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，那么该合同是有效的。在此情况下，甲方明知乙方是乙肝患者仍然签订合同，后又拒绝乙方居住，构成违约。根据《民法典》第五百七十七条：“当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。”乙方有权要求甲方承担违约责任，包括退还租金、赔偿损失等。
合同无效或可撤销情形：
- 若甲方在签订合同时存在欺诈、胁迫等情形，导致乙方在违背真实意思的情况下签订合同，那么乙方有权请求人民法院或者仲裁机构撤销该合同。合同被撤销后，因该合同取得的财产，应当予以返还；不能返还或者没有必要返还的，应当折价补偿。有过错的一方应当赔偿对方因此所受到的损失。在此情况下，乙方可以要求甲方退还租金。但需注意，乙方需承担举证责任，证明甲方存在欺诈、胁迫等行为。
- 若合同内容存在违反法律、行政法规的强制性规定或违背公序良俗的情形，如合同中约定了对乙肝患者的歧视性条款，那么该合同可能被认定为无效。合同无效后，因该合同取得的财产，应当予以返还。乙方同样可以要求甲方退还租金。
二、实际履行角度
- 若甲方虽然拒绝乙方居住，但乙方已经实际支付了租金，且甲方未提供任何居住服务或替代性服务，那么从公平原则出发，甲方应当退还乙方租金。因为甲方未履行合同约定的主要义务，乙方有权要求解除合同并退还租金。
三、建议与风险提示
建议：
- 乙方应首先与甲方进行协商，尝试通过友好方式解决纠纷。协商过程中，乙方可以明确指出甲方的违约行为，并要求甲方退还租金。
- 若协商无果，乙方可以收集相关证据（如合同、付款凭证、沟通记录等），向人民法院提起诉讼或向仲裁机构申请仲裁，要求甲方承担违约责任并退还租金。
风险提示：
- 乙方在提起诉讼或申请仲裁前，应确保自己掌握足够的证据来支持自己的主张。否则，可能面临败诉的风险。
- 乙方在维权过程中，应注意保护自己的个人信息和隐私，避免泄露给无关第三方。
总结：乙方在甲方明知其是乙肝患者仍然签订旅居协议但又拒绝其居住的情况下，能否要回租金取决于合同的效力、实际履行情况以及乙方的举证能力。若合同有效且甲方构成违约，或合同无效/可撤销，或从公平原则出发，乙方均有权要求甲方退还租金。建议乙方在维权过程中收集相关证据，并咨询专业律师以获取更具体的法律建议。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。