在交通事故被认定为工伤的情况下，医疗费用的赔付涉及多个方面，以下是对此问题的详细解答：

一、医疗费用赔付的基本原则

根据《工伤保险条例》及相关规定，治疗工伤所需的医疗费用需符合工伤保险诊疗项目目录、工伤保险药品目录及工伤保险住院服务标准。这包括挂号费、诊疗费、医药费、住院费（含床位费、护理费）、康复性治疗费用以及辅助器具安装配置费等。

二、赔偿主体与流程

1. 责任划分：

   • 若交通事故由第三方侵权导致，首先应通过民事赔偿途径向责任方追偿。若民事赔偿不足以覆盖全部医疗费用，不足部分可由工伤保险基金或用人单位补足。
   • 若交通事故非第三方责任，则医疗费用直接由工伤保险基金或用人单位承担。

2. 申报程序：

   • 用人单位需在事故发生之日起30日内向劳动保障行政部门提交工伤认定申请。
   • 若用人单位未按时提出申请，工伤职工或其近亲属可在一年内自行提出工伤认定申请。
   • 工伤认定成功后，需进行劳动能力鉴定以确定伤残等级，这是后续赔偿处理的重要依据。

三、医疗费用赔付的具体内容

1. 医疗费用：

   • 包括急救费、手术费、药费等必要支出。
   • 需提供正规医疗机构出具的发票及费用清单作为赔付依据。

2. 康复费用：

   • 经确认的康复治疗项目，如物理治疗、职业训练等，可全额报销。

3. 辅助器具费：

   • 按国家标准配置的假肢、轮椅等辅助器具费用，由工伤保险基金承担。

四、双重赔偿的处理原则

• 在交通事故与工伤赔偿中，部分费用如医疗费等实际发生且已在交通事故中获得赔偿的，工伤保险基金不再重复支付。
• 但对于交通事故赔偿中没有涉及的项目，或者赔偿金额低于工伤赔偿标准的部分，工伤保险可以补足差额。例如，一次性伤残补助金、伤残津贴等工伤待遇与交通事故的残疾赔偿金等，通常可以同时获得。

五、争议处理机制

若对赔偿金额或责任认定存在异议，可通过以下途径解决：

1. 向当地社会保险行政部门提出复核申请。
2. 申请劳动仲裁委员会进行调解仲裁。
3. 通过司法诉讼维护合法权益。

六、注意事项

• 不同地区对于交通事故认定工伤后的赔偿规定和操作流程可能存在差异，需依据当地法律法规和政策执行。
• 在实际处理过程中，建议及时申请工伤认定和劳动能力鉴定，并保留好交通事故处理过程中的相关证据，如事故责任认定书、医疗费用发票等。
• 与用人单位保持良好沟通，确保工伤赔偿流程能顺利进行。

综上所述，交通事故认定工伤后的医疗费用赔付涉及多个方面，需根据具体情况和当地法律法规进行操作。如有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时咨询相关部门或专业人士。