结论：关于您提到的“两个人合伙开店我管钱，卡里的钱我用了一百，到时候发工资是不是我少一百，对方多”的问题，这并非一个简单的数学加减问题，而是涉及到合伙财务管理和责任划分的问题。一般情况下，如果您未经对方同意擅自使用合伙资金，那么在发工资时，您需要补回这一百元，以确保合伙资金的完整性和公平性；但如果对方同意或事后追认，则可能不需要补回。以下从不同角度进行分析：
一、合伙资金的管理原则
在合伙经营中，资金的管理应当遵循透明、公正和共同决策的原则。作为管钱的一方，您有责任确保合伙资金的安全和合理使用，并定期向另一方报告资金的使用情况。如果您未经对方同意擅自使用了合伙资金，这可能构成对合伙协议的违反，也可能引发信任问题。
二、擅自使用合伙资金的后果
责任划分：如果您擅自使用了合伙资金，那么在发工资时，您需要承担补回这一百元的责任。这是因为合伙资金是双方共同所有的，任何一方都无权擅自使用。补回资金是为了确保合伙资金的完整性和公平性，也是对您擅自使用资金行为的一种纠正。
信任问题：擅自使用合伙资金还可能引发另一方对您的信任问题。在合伙经营中，信任是基础。如果您经常擅自使用资金，那么另一方可能会对您的财务管理能力产生质疑，甚至可能考虑终止合伙关系。
三、对方同意或事后追认的情况
当然，也存在一种特殊情况，即如果您在使用这一百元之前已经得到了对方的同意，或者事后对方追认了您的使用行为，那么您可能不需要补回这一百元。但这种情况需要明确的证据支持，比如聊天记录、书面协议等。
四、建议与措施
加强沟通：为了避免类似的纠纷发生，建议您与另一方加强沟通，明确合伙资金的使用规则和审批流程。任何一方在使用资金之前，都应当得到另一方的同意或授权。
建立财务管理制度：您可以与另一方共同制定一套财务管理制度，明确资金的收支、审批、报销等流程。这有助于规范资金的使用，减少纠纷的发生。
及时补回资金：如果您已经擅自使用了合伙资金，那么建议您尽快补回这一百元，并向另一方说明情况，以维护合伙关系的稳定和信任。
作为专业律师，我建议您在合伙经营中务必遵守相关法律法规和合伙协议的规定，确保合伙资金的合法、合规使用。如果您在合伙经营中遇到任何法律问题或纠纷，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议和帮助。