代替别的公司收款是否违法，不能一概而论，需要分情况讨论：
合法代收情况：
- 有合法授权：如果代收行为是基于双方公司的明确约定，并且有合法的授权文件（如委托收款协议），且代收行为在授权范围内进行，那么这种代收行为是合法的。例如，A公司因业务需要，委托B公司代为收取某笔款项，并签订了正式的委托收款协议，明确了代收的范围、金额、时间等关键条款，这种情况下B公司的代收行为就是合法的。
- 符合行业惯例或交易习惯：在某些特定行业或交易中，代收行为可能成为一种行业惯例或交易习惯。例如，在物流行业中，物流公司可能会代为收取货物的运费或货款，这种代收行为如果符合行业惯例，且双方对此有明确的约定或认可，那么也是合法的。
违法代收情况：
- 无合法授权或超出授权范围：如果代收行为没有合法的授权文件，或者超出了授权范围，那么这种代收行为就可能构成违法。例如，未经A公司同意，B公司擅自代为收取A公司的款项，或者虽然签订了委托收款协议，但代收金额超出了协议约定的范围，这些情况下B公司的代收行为就可能违法。
- 以代收为名进行欺诈或挪用资金：如果代收行为实际上是以代收为名，行欺诈或挪用资金之实，那么这种行为不仅违法，还可能构成犯罪。例如，B公司以代收A公司款项为名，将收取的款项用于自己的经营活动或个人消费，甚至卷款潜逃，这种行为就构成了欺诈或挪用资金罪。
法律后果与建议：
- 法律后果：违法代收行为可能面临民事赔偿、行政处罚甚至刑事责任。如果代收行为给对方公司造成了经济损失，那么代收方可能需要承担民事赔偿责任；如果代收行为违反了相关行政法规或规章，那么代收方可能面临行政处罚；如果代收行为构成了犯罪，那么代收方将面临刑事责任的追究。
- 建议：为了避免违法代收行为的发生，建议双方公司在进行代收行为前，务必签订正式的委托收款协议，明确代收的范围、金额、时间等关键条款，并确保代收行为在授权范围内进行。同时，代收方在代收款项后，应及时将款项转交给委托方，并保留好相关的转账记录或收据等证据，以备不时之需。
总结来说，代替别的公司收款是否违法，取决于代收行为是否合法授权、是否符合行业惯例或交易习惯，以及是否存在欺诈或挪用资金等违法行为。因此，在进行代收行为时，务必谨慎行事，确保代收行为的合法性和合规性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。