新公司法颁布后，总经理是否可以由股东指定，这个问题不能一概而论，需要分情况讨论：

1. 有限责任公司的情况：

   • 一般规定：根据《中华人民共和国公司法》的相关规定，有限责任公司可以设经理，由董事会决定聘任或者解聘。这意味着，在一般的有限责任公司中，总经理（经理）的聘任和解聘权通常归属于董事会，而非股东直接指定。
   • 特殊情况：如果公司章程有特别规定，比如明确约定总经理由某股东或某股东指定的代表担任，那么在这种情况下，总经理可以由股东根据章程的约定进行指定。但这种情况较为特殊，需要公司章程有明确的条款支持。

2. 股份有限公司的情况：

   • 一般规定：对于股份有限公司，同样地，经理（总经理）由董事会决定聘任或者解聘。这是公司法对于股份有限公司治理结构的基本要求，旨在确保公司管理的专业性和独立性。
   • 无特殊规定：与有限责任公司不同，股份有限公司的公司章程通常不会特别约定总经理由股东指定，因为这可能违背公司治理的基本原则，即所有权与经营权分离。因此，在股份有限公司中，总经理一般不由股东直接指定。

法律背景与建议：

• 公司治理原则：公司法的设计旨在平衡公司内部各利益相关者的权益，确保公司运营的效率和公平。总经理作为公司的高级管理人员，其聘任和解聘应当遵循公司治理的基本原则，即由董事会根据公司的经营需要和总经理的履职情况来决定。
• 公司章程的重要性：公司章程是公司的“宪法”，它规定了公司的基本制度和治理结构。如果股东希望在公司中拥有更大的话语权，包括指定总经理的权力，那么应当在公司章程中明确约定。但这样的约定应当合法、合规，并且不违背公司治理的基本原则。
• 法律风险：如果股东试图通过非正当手段（如操纵董事会、违反公司章程等）来指定总经理，那么可能会面临法律风险。这不仅可能损害公司的利益，还可能引发股东之间的纠纷和诉讼。

可能的后行动建议：

• 如果您是股东，并且希望在公司中拥有指定总经理的权力，那么建议您首先查阅公司章程，了解其中关于总经理聘任和解聘的规定。如果公司章程没有相关规定，或者您希望修改相关规定，那么应当与其他股东协商一致，并通过合法的程序来修改公司章程。
• 如果您是公司的高级管理人员或董事会成员，并且面临股东试图指定总经理的情况，那么建议您坚守公司治理的基本原则，根据公司的经营需要和总经理的履职情况来做出决策。同时，您也可以向股东解释公司治理的重要性，以及非正当指定总经理可能带来的法律风险。

总之，新公司法颁布后，总经理是否可以由股东指定取决于公司的类型和公司章程的规定。在一般情况下，总经理由董事会决定聘任或者解聘。如果您有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。