新的生态环境监测条例一般不能直接对以前的违法行为进行处罚，但存在例外情况。以下从不同角度进行分析：

一、一般原则：法不溯及既往

在法律原则中，“法不溯及既往”是一项基本原则，即新颁布的法律通常不适用于其生效前已经发生的行为。这一原则旨在保护公民、法人和其他组织的合法权益，避免因法律的突然变化而受到不公平的处罚。因此，在一般情况下，新的生态环境监测条例不能直接对条例生效前的违法行为进行处罚。

二、例外情况：有利追溯原则

尽管“法不溯及既往”是基本原则，但法律也规定了例外情况，即“有利追溯原则”。这一原则指的是，如果新法对行为人更为有利，那么新法可以适用于其生效前的行为。在生态环境监测领域，如果新的条例对违法行为人的处罚更轻或者提供了更合理的救济途径，那么根据有利追溯原则，新的条例有可能被适用于条例生效前的违法行为。不过，这种情况需要具体分析新条例的具体条款和违法行为的具体情况。

三、具体应用中的考量因素

1. 新条例的具体规定：需要仔细审查新条例中关于溯及力的具体规定。如果新条例明确规定了其适用于条例生效前的某些违法行为，那么应当按照新条例的规定执行。

2. 违法行为的性质：违法行为的性质也是决定是否适用新条例的重要因素。如果违法行为严重危害生态环境，且新条例对此类行为有更为严格的处罚规定，那么从保护生态环境的角度出发，有可能适用新条例进行处罚。但这种情况需要严格的法律解释和司法判断。

3. 司法实践中的做法：在实际操作中，法院或行政机关在处理类似案件时，会综合考虑新条例的规定、违法行为的性质以及社会公共利益等因素，来决定是否适用新条例进行处罚。因此，司法实践中的做法也是判断新条例能否适用于以前违法行为的重要参考。

四、建议与风险提示

对于涉及生态环境监测的违法行为，如果行为发生在新的生态环境监测条例生效前，且新条例未明确规定溯及力，那么一般应按照行为发生时的法律进行处理。然而，由于法律解释和司法实践的复杂性，建议行为人或相关方在面临此类问题时，及时咨询专业律师，以获取准确的法律意见和风险提示。

如有任何关于生态环境监测条例或侵权损害（环境污染）方面的法律问题，可以直接向我咨询。