结论：开发商要求您无偿移交商业车位给政府并签署相关协议，同时要求您保密，这一行为是否合法，需从多个角度进行分析，包括协议内容、政府征收程序以及保密条款的合法性等。

1. 协议内容的合法性：

   • 首先，需要审查您与开发商签订的协议内容。如果协议中明确规定了您需要无偿移交商业车位给政府，并且这一条款不违反法律法规的强制性规定（如没有违反公平、等价有偿等原则），那么从协议本身来看，这一条款可能是有效的。
   • 然而，如果协议中的这一条款存在欺诈、胁迫、显失公平等情形，您有权请求人民法院或者仲裁机构变更或者撤销该协议。

2. 政府征收程序的合法性：

   • 政府征收商业车位必须遵循法定程序，包括发布征收公告、进行征收补偿协商、签订征收补偿协议等。如果政府未按照法定程序进行征收，或者征收目的不合法（如非为了公共利益需要），那么征收行为可能是违法的。
   • 在您的情况下，如果开发商是代表政府进行征收，并且政府已经按照法定程序进行了征收，那么您可能需要配合政府的征收工作。但如果您认为征收程序存在违法之处，您有权提出异议并寻求法律救济。

3. 保密条款的合法性：

   • 保密条款本身并不违法，但保密的内容和范围必须合法。如果保密条款要求您对政府征收商业车位的合法行为进行保密，这可能不构成违法。然而，如果保密条款要求您对开发商或政府的违法行为进行保密，那么这一条款可能是违法的，因为您没有义务为违法行为保密。
   • 此外，即使保密条款本身合法，如果其内容过于宽泛或不合理，也可能被认定为无效。例如，如果保密条款要求您对所有与商业车位相关的事项进行保密，包括那些您本应有权公开的信息，那么这一条款可能是不合理的。

4. 您的权利与义务：

   • 作为车位的使用者或所有者，您有权了解政府征收商业车位的合法性和程序，并有权获得合理的补偿。
   • 如果您认为开发商或政府的行为存在违法之处，您有权提出异议并寻求法律救济。这包括向相关部门投诉、提起行政诉讼或民事诉讼等。

建议：

• 在签署任何协议之前，请务必仔细阅读协议内容，并咨询专业律师的意见。
• 如果您对政府征收商业车位的合法性或程序存在疑问，可以向相关部门咨询或申请信息公开。
• 如果您认为开发商或政府的行为侵犯了您的合法权益，请及时寻求法律救济。

可能后果：

• 如果您签署了包含违法条款的协议，可能会面临法律纠纷和损失。
• 如果您未按照政府征收程序配合征收工作，可能会面临行政处罚或强制执行等后果。

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