结论：自来水改管改造过程中，门市房若因改造方原因被拒绝进入导致停水，这种行为一般是不合法的。以下从多个角度进行分析：

一、从供水合同的角度分析

1. 供水合同关系：门市房与自来水公司之间通常存在供水合同关系，自来水公司有义务按照合同约定向门市房提供符合质量标准的自来水。改造方若因改造工作而阻止自来水进入门市房，实际上是在干扰这一合同关系的正常履行。

2. 违约责任：如果改造方的行为导致门市房长时间停水，且这种停水是由于改造方的不当行为造成的，那么改造方可能构成对供水合同关系的干扰，需要承担相应的违约责任或侵权责任。门市房有权要求改造方恢复供水，并可能要求赔偿因此造成的损失。

二、从相邻关系的角度分析

1. 相邻权：根据《民法典》中关于相邻关系的规定，不动产的相邻权利人应当按照有利生产、方便生活、团结互助、公平合理的原则，正确处理相邻关系。改造方在进行自来水改管改造时，应当尽量减少对门市房正常用水的影响。

2. 侵权责任：如果改造方的行为严重影响了门市房的正常用水，且这种影响超出了合理范围，那么改造方可能构成对门市房相邻权的侵犯。门市房有权要求改造方停止侵害、排除妨碍，并可能要求赔偿因此造成的损失。

三、从实际操作和合理性的角度分析

1. 改造方案的合理性：改造方在进行自来水改管改造时，应当制定合理的改造方案，确保改造工作不会对门市房的正常用水造成严重影响。如果改造方案存在明显不合理之处，导致门市房长时间停水，那么改造方可能需要承担相应的责任。

2. 沟通与协商：在改造过程中，改造方应当与门市房进行充分的沟通与协商，共同寻找解决问题的最佳方案。如果改造方未经沟通与协商就擅自采取停水措施，那么这种行为显然是不合理的。

四、建议与措施

1. 与改造方沟通：门市房可以首先尝试与改造方进行沟通，了解改造工作的具体情况和预计停水时间，要求改造方尽快恢复供水或提供临时供水方案。

2. 寻求法律援助：如果沟通无果或改造方拒绝恢复供水，门市房可以寻求法律援助，通过法律途径维护自己的合法权益。这包括向相关部门投诉、提起民事诉讼等。

3. 保留证据：在处理此类纠纷时，门市房应当注意保留相关证据，如停水通知、沟通记录、损失证明等，以便在需要时提供有力的证据支持。

总结来说，自来水改管改造过程中，改造方若因不当行为导致门市房停水，这种行为一般是不合法的。门市房有权要求改造方恢复供水并赔偿损失。在处理此类纠纷时，建议门市房首先与改造方进行沟通协商，如果无法解决问题，可以寻求法律援助并保留相关证据。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。