刑事案件中的笔录有问题，一般不可以直接提起行政诉讼。以下是对此问题的详细分析：
一、刑事案件笔录与行政诉讼的关系
刑事案件中的笔录，是公安机关、检察机关在侦查、审查起诉阶段，对犯罪嫌疑人、证人等进行的询问或讯问记录。这些笔录主要用于刑事案件的侦查、起诉和审判，是刑事诉讼程序中的重要证据。而行政诉讼，则是公民、法人或其他组织认为行政机关的行政行为侵犯其合法权益时，向人民法院提起的诉讼。行政诉讼的标的通常是行政机关的具体行政行为，如行政处罚、行政许可等。
二、为何不能直接提起行政诉讼
性质不符：刑事案件笔录是刑事诉讼程序中的证据，其性质与行政诉讼的标的——行政行为，存在本质区别。行政诉讼解决的是行政机关与公民、法人或其他组织之间的行政争议，而刑事案件笔录问题并不直接构成这种争议。
程序不同：刑事案件笔录的异议，通常应在刑事诉讼程序内提出，如通过申请排除非法证据、申请重新鉴定或勘验等方式进行救济。而行政诉讼则是独立的诉讼程序，其启动需要满足特定的条件，如存在行政行为、该行为侵犯了合法权益等。
救济途径：如果认为刑事案件笔录存在问题，如笔录内容不真实、笔录程序违法等，应当通过刑事诉讼程序内的救济途径进行解决，如向侦查机关提出异议、申请检察机关监督等。而不是直接提起行政诉讼。
三、特殊情况下的处理
虽然一般情况下不能直接提起行政诉讼，但在某些特殊情况下，如果刑事案件笔录问题与行政机关的行政行为存在关联，且该行政行为侵犯了合法权益，那么可能间接引发行政诉讼。例如，如果公安机关在刑事侦查过程中，违法采取了行政强制措施（如拘留、查封等），并制作了相关笔录，而当事人认为该行政强制措施违法并侵犯了其合法权益，那么当事人可以针对该行政强制措施提起行政诉讼。但此时，诉讼的标的并非笔录本身，而是行政强制措施这一行政行为。
四、建议
如果您认为刑事案件中的笔录存在问题，建议您首先通过刑事诉讼程序内的救济途径进行解决。如果问题确实与行政机关的行政行为有关，且该行为侵犯了您的合法权益，那么您可以考虑提起行政诉讼。但在此之前，请务必咨询专业律师，以准确判断您的权益是否受到侵犯以及应采取何种救济途径。
如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。