是否构成虚开增值税专用发票罪需分情况讨论，关键在于是否存在真实的货物交易及发票开具是否符合税法规定。具体分析如下：

1. 若存在真实货物交易，仅因交易流程不规范导致“票货分离”，一般不构成虚开增值税专用发票罪
   根据《刑法》第二百零五条及司法实践，虚开增值税专用发票罪的构成需以“无真实交易”为前提。若您与A存在真实的货物买卖关系，但因A无法开具发票，转而由B公司开具与实际交易相符的发票（如B公司实际参与了货物运输、仓储等环节，或存在挂靠经营等合法情形），且发票内容（货物名称、数量、金额等）与实际交易一致，则属于“代开”行为。根据《国家税务总局关于纳税人对外开具增值税专用发票有关问题的公告》（2014年第39号），此类行为若满足“纳税人向受票方纳税人销售了货物，或提供了增值税应税劳务、应税服务；纳税人向受票方纳税人收取了所销售货物、所提供应税劳务或者应税服务的款项，或取得了索取销售款项的凭据；纳税人按规定向受票方纳税人开具的增值税专用发票相关内容，与所销售货物、所提供应税劳务或者应税服务相符，且该增值税专用发票是纳税人合法取得、并以自己名义开具的”，不构成虚开。

2. 若不存在真实货物交易，或发票内容与实际交易不符，则可能构成虚开增值税专用发票罪
   若您与A之间无实际货物交易，仅通过支付“开票费”等方式让B公司开具与实际业务无关的发票（如虚构交易、虚增金额、改变货物名称等），或B公司明知您与A无真实交易仍开具发票，则属于“为他人虚开”或“让他人为自己虚开”行为。根据《刑法》第二百零五条，此类行为可能被认定为虚开增值税专用发票罪，面临三年以下有期徒刑或拘役，并处二万元至二十万元罚金；虚开税款数额较大或有其他严重情节的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处五万元至五十万元罚金；虚开税款数额巨大或有其他特别严重情节的，处十年以上有期徒刑或无期徒刑，并处五万元至五十万元罚金或没收财产。

建议：

• 立即核查与A、B之间的交易记录、合同、付款凭证、货物运输单据等证据，确认是否存在真实交易及发票内容是否一致；
  
• 若存在合规风险，尽快补缴税款、调整账务，并向税务机关说明情况，争取从轻处理；
  
• 涉及刑事风险的，及时委托专业律师介入，通过刑事合规审查、证据固定等方式降低法律后果。
  

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作细节。