结论：在通过执行和解后被执行人按协议还清了欠款的情况下，法院通常不会就和解后还的款子再收取执行费，但具体是否收取还需根据和解协议的内容以及执行和解的具体情况来判断。

分析说明：

1. 执行和解的性质与费用承担：

   • 执行和解是执行过程中，双方当事人通过协商，就执行标的的履行方式、期限、金额等达成一致意见，并形成书面协议的行为。
   • 执行和解协议一旦达成并履行完毕，通常意味着原执行案件的终结，法院不再继续执行原判决或裁定。
   • 关于执行费的承担，一般而言，执行费是由被执行人承担的，这是基于执行程序的基本原则。但在执行和解的情况下，如果双方当事人在和解协议中明确约定了执行费的承担方式，那么应按照和解协议的约定来执行。

2. 和解后还清欠款与执行费的关系：

   • 如果被执行人按照和解协议的约定还清了欠款，且和解协议中未明确约定需要额外支付执行费，那么法院通常不会就和解后还的款子再收取执行费。
   • 然而，如果和解协议中明确约定了即使被执行人按协议还清欠款，仍需支付一定金额的执行费，或者将执行费作为和解协议的一部分进行约定，那么被执行人就需要按照协议约定支付执行费。

3. 特殊情况下的执行费收取：

   • 在某些特殊情况下，如被执行人未完全按照和解协议履行义务，导致执行程序重新启动的，法院可能会根据实际情况重新计算并收取执行费。
   • 另外，如果和解协议被撤销或被认定无效，且原执行案件需要恢复执行的，法院也可能会根据恢复执行的情况重新收取执行费。

法律建议：

• 在签订执行和解协议时，双方当事人应明确约定执行费的承担方式，以避免后续产生争议。
• 如果被执行人已经按照和解协议还清了欠款，且对执行费的收取有疑问或异议的，可以及时向法院提出，并要求法院进行解释或说明。
• 在任何情况下，都建议双方当事人保留好和解协议、还款凭证等相关证据材料，以便在需要时进行查证或维权。

后续行动指南：

• 如果您对执行和解后执行费的收取问题仍有疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供详细的法律解答和建议。