结论前置：是否可以在离职申请上注明赔偿并签字，需分情况讨论，具体如下：

1. 若赔偿条款合法合理且双方协商一致
   若离职申请中注明的赔偿条款（如经济补偿金、未休年假工资、加班费等）符合《劳动合同法》及相关法规，且你与用人单位已就赔偿金额、支付方式等核心条款达成一致，可以签字。此时签字视为双方对离职补偿的书面确认，具有法律效力，可有效避免后续争议。
   法律依据：根据《劳动合同法》第46-47条，用人单位提出协商解除劳动合同或因特定情形（如裁员、劳动合同到期不续签等）终止劳动关系的，需支付经济补偿金，标准为“每满一年支付一个月工资”。若条款与此一致，则合法有效。

2. 若赔偿条款存在违法或显失公平情形
   若离职申请中注明的赔偿条款违反法律强制性规定（如要求员工支付“违约金”但不符合《劳动合同法》第22-23条规定的情形），或赔偿金额明显低于法定标准（如经济补偿金计算错误），不建议签字。此时签字可能被认定为“放弃合法权益”，后续维权难度增加。
   风险提示：根据《劳动合同法》第26条，违反法律、行政法规强制性规定的劳动合同条款无效。若签字后发现权益受损，仍可通过劳动仲裁主张权利，但需承担举证责任（如证明签字时存在胁迫、欺诈或重大误解）。

3. 若赔偿条款未明确或存在模糊表述
   若离职申请中仅笼统注明“赔偿”但未明确赔偿项目、金额、支付时间等核心要素，建议谨慎签字。此类条款可能因“约定不明”引发争议，例如用人单位可能以“赔偿”涵盖非法定项目（如“培训费”“竞业限制补偿”等），导致你实际获得的补偿低于法定标准。
   操作建议：要求用人单位补充明确条款内容，或另行签订书面协议（如《离职补偿协议》），避免口头约定。

总结建议：签字前务必核对赔偿条款是否符合以下三点：

• 是否与法定标准一致（如经济补偿金、加班费等）；
  
• 是否明确赔偿项目、金额、支付方式及时间；
  
• 是否排除用人单位的违法责任（如未缴纳社保、拖欠工资等）。
  若存在疑问，可直接向我咨询，我会结合具体条款为你分析风险。