协议书约定永久居住权在符合法律规定的情况下是有效的，但需注意“永久居住权”的法律性质及设立条件。以下是对此问题的详细分析：

一、协议书约定永久居住权的有效性

1. 行为人具备民事行为能力：

   • 签订协议的双方必须均为完全民事行为能力人，能够理解和承担协议所带来的法律后果。这是协议有效的基础前提。

2. 意思表示真实无欺：

   • 协议签订应基于双方平等、自愿的基础，经过充分协商，不存在欺诈、胁迫、重大误解等情形。双方需明确表达自己的真实意愿，确保协议内容的真实性。

3. 合法合规：

   • 协议内容不得违反法律、行政法规的强制性规定，也不得违背公序良俗。虽然“永久居住权”并非法律专业术语，但若协议中涉及的是房屋的长时间或无限期使用权，且该使用权转让行为不违反相关房地产法律法规，则协议在内容上可能是合法的。

4. 书面形式与登记：

   • 根据《民法典》的规定，设立居住权应采用书面形式订立合同，并向登记机构申请居住权登记。居住权自登记时设立。因此，即使协议中约定了“永久居住权”，也需依法进行登记，以确保其法律效力。

二、“永久居住权”的法律性质及限制

1. 居住权是一种用益物权：

   • 居住权人对他人的住宅享有占有、使用的权利，以满足生活居住的需要。但“永久”并不意味着无期限，它仍然可能受到一些客观因素的限制，如居住权人死亡、住宅灭失等，这些情况会导致居住权消灭。

2. 居住权具有人身专属性：

   • 居住权是为特定自然人的生活居住需要而设定的权利，通常不得转让、继承。它是与居住权人的人身紧密相连的，只能由居住权人本人享有和行使。

3. 居住权的设立需依法登记：

   • 未经登记，不发生居住权设立的法律效力。这是为了保障居住权的公示性和稳定性，维护交易安全。因此，即使协议中约定了“永久居住权”，也需依法进行登记，否则该权利无法得到法律保护。

三、实际操作建议

1. 明确协议内容：

   • 在签订协议时，应明确约定居住权的期限、范围、使用方式等具体内容，以避免未来可能产生的纠纷。

2. 依法进行登记：

   • 签订书面协议后，应及时向登记机构申请居住权登记，以确保居住权的法律效力。

3. 考虑公证或律师见证：

   • 为增强协议的法律效力，建议在签订后前往公证处进行公证，或邀请律师见证签约过程。

举例说明：假设甲与乙签订了一份协议书，约定乙在甲的房屋中享有永久居住权。若该协议满足上述有效性条件，且依法进行了登记，则乙在协议约定的范围内享有对该房屋的居住权。但若乙死亡或房屋灭失，则乙的居住权将消灭。

总结来说，协议书约定永久居住权在符合法律规定的情况下是有效的，但需注意“永久居住权”的法律性质及设立条件。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。