企业两次发工资是否合法，需结合具体情况进行综合判断，关键在于单位是否按时足额支付工资，以及是否存在违反相关法律法规的行为。以下是对此问题的详细分析：

合法情形

1. 企业正常管理安排：

   • 企业根据自身的薪酬管理制度，将工资合理拆分为基本工资、绩效工资等不同部分，并在不同时间发放。例如，每月月初发放基本工资以保障员工基本生活需求，月底根据绩效评估结果发放绩效工资以激励员工。只要两次发放的工资总额不低于当地最低工资标准，且符合劳动合同的约定，这种做法就是合法的。

2. 出于合理税务筹划：

   • 在遵守法律法规的前提下，企业对工资发放方式进行合理安排，如将一部分工资以福利形式发放，另一部分以现金形式发放，整体符合税法规定和企业薪酬制度，也是合法的。但需注意，这种安排不能以逃避税收、社保缴纳等法定义务为目的。

3. 遵守支付规定：

   • 根据《工资支付暂行规定》，用人单位应按月及时足额发放工资，并书面记录支付劳动者工资的数额、时间、领取者的姓名及签字，保存两年以上备查。只要企业满足这些条件，即使工资分两次发放，也是合法的。

违法情形

1. 恶意拆分逃避义务：

   • 企业为逃避缴纳社保、公积金或个人所得税等法定义务，故意将工资分两次发放，并向有关部门隐瞒真实工资收入情况，属于违法行为。这种行为违反了《社会保险法》、《住房公积金管理条例》及税收相关法律法规，企业可能面临税务机关的处罚，包括追缴少缴税款、加收滞纳金以及可能的罚款等。

2. 未足额按时支付：

   • 如果企业分两次发放工资，但每次发放的时间和金额都不固定，导致员工无法按时足额获得劳动报酬，影响员工正常生活，则属于违法行为。这违反了《劳动法》第五十条关于“工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资”的规定。员工有权要求企业足额支付工资，并可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求支付拖欠工资及相应的经济补偿。

总结与建议

综上所述，企业两次发工资是否合法取决于多个因素，包括单位是否按时足额支付工资、是否存在违反相关法律法规的行为等。如果企业出于合理的管理安排或税务筹划目的，且按时足额支付了工资，那么这种做法是合法的；但如果企业以此为借口逃避法定义务或未按时足额支付工资，则属于违法行为。

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