若农民工工资民事诉讼开庭时被告不到庭，法院会根据不同情况作出相应处理，核心结论如下：

1. 被告经合法传唤无正当理由拒不到庭
   根据《民事诉讼法》第147条，若法院已依法向被告送达开庭传票，且被告无正当理由拒不到庭，法院可进行缺席判决。此时法院会依据原告提交的证据（如劳动合同、工资欠条、考勤记录等）审查案件事实，若证据充分且符合法律规定，将直接判决被告支付拖欠工资及可能产生的利息、违约金等。
   例如：若原告提交了被告签字确认的工资欠条，且被告未到庭抗辩或提供反驳证据，法院通常会支持原告的诉讼请求。

2. 被告下落不明或无法送达传票
   若被告因下落不明导致传票无法送达，法院会通过公告送达（如在法院公告栏、国家级媒体刊登公告）通知被告。公告期满（通常为30日）后，若被告仍未到庭，法院同样可缺席判决。但需注意，若被告下落不明涉及恶意逃避债务，原告可在诉讼中申请财产保全，冻结被告名下财产（如银行账户、房产等），为后续执行提供保障。

3. 被告到庭后中途退庭
   若被告到庭但未经法庭许可中途退庭，法院可视为其放弃答辩权利，继续审理并缺席判决。此时被告的退庭行为不影响案件实体审理，但若其退庭导致关键事实无法查清（如被告主张已支付部分工资但未举证），可能承担不利后果。

执行阶段的关键措施：
若法院判决被告支付工资后，被告仍不履行，原告可向法院申请强制执行。法院会通过以下方式执行：

• 查询、冻结、划拨被告名下存款；
  
• 查封、扣押、拍卖被告名下房产、车辆等财产；
  
• 限制被告高消费（如禁止乘坐飞机、高铁，禁止子女就读私立学校等）；
  
• 将被告纳入失信被执行人名单，影响其信用记录及社会评价。
  

温馨提示：若您作为农民工遇到工资拖欠问题，建议提前收集证据（如劳动合同、工资条、欠条、考勤记录等），并在诉讼中明确诉求（如工资本金、利息、维权合理支出等）。若被告可能转移财产，可同步申请财产保全以保障权益。如有具体案件细节需进一步分析，可直接向我咨询。