公司让员工与代发工资的第三方签订与工作不同的劳动合同，其合法性需结合具体情况和法律规定进行综合判断。以下是对此问题的详细分析：
合法情况
劳务派遣的合法情形：
- 若公司通过正规的劳务派遣公司，安排员工与劳务派遣公司签订劳动合同，再由劳务派遣公司将员工派遣到公司工作，且符合劳务派遣的相关规定（如劳务派遣单位依法设立，注册资本不少于人民币二百万元，与被派遣劳动者订立二年以上的固定期限劳动合同，按月支付劳动报酬及缴纳社会保险等），同时用工单位仅在临时性、辅助性或替代性的工作岗位上使用被派遣劳动者，且使用数量未超过其用工总量的一定比例，则该行为是合法的。
- 关键点：劳务派遣的合法性取决于派遣单位资质、合同期限、劳动报酬支付、社会保险缴纳以及用工岗位和比例等是否符合法律规定。
劳务外包的合法情形：
- 若公司将部分业务外包给第三方公司，第三方公司自主招聘员工完成相应业务，且公司与这些员工不存在直接的劳动关系，则公司让员工与第三方签订劳动合同（尽管工作内容可能与在公司时不同）也是合法的。
- 关键点：劳务外包的合法性在于公司是否将业务外包给了有资质的第三方，且员工与第三方公司之间形成了独立的劳动关系。
协商一致的合法情形：
- 若公司与职工协商一致后，解除原劳动合同，再让职工与第三方签订新劳动合同，且新合同的内容（包括工作岗位、劳动报酬等）均经双方协商一致，则该行为同样属于合法行为。
- 关键点：协商一致的合法性在于双方是否在平等、自愿的基础上达成了合意，且新合同的内容不违反法律法规的强制性规定。
不合法情况
规避法律责任的违法情形：
- 若公司为逃避社保缴纳、经济补偿等劳动法律责任，故意让员工与第三方签订合同，而员工实际工作内容、场所、管理等均未改变，仅是为了规避法律责任而进行的操作，则这种行为是违法的。
- 法律后果：员工可通过劳动监察、劳动仲裁等途径维护自身权益，要求公司承担相应法律责任。
未履行告知义务或未协商一致的违法情形：
- 若公司未向员工明确说明与第三方签订合同的原因、性质及可能产生的影响，导致员工在不了解真实情况下签订合同，损害了员工的知情权和选择权，则属违法行为。
- 若公司单方面要求员工与第三方签订劳动合同，未经协商一致，也违反了劳动者平等就业和选择职业的权利。
- 法律后果：员工有权拒绝签订此类合同，并可通过法律途径维护自身权益。
法律建议
- 对于公司：应确保自身行为符合法律法规要求，充分尊重并保障员工的合法权益。在安排员工与第三方签订劳动合同时，应明确告知员工合同签订的原因、性质及可能产生的影响，并确保合同内容合法、合规。
- 对于员工：在面对此类情况时，应积极了解自己的权益和义务，仔细阅读合同条款，确保合同内容符合自己的真实意愿。如有疑问或发现违法行为，应及时向公司提出异议或寻求专业法律帮助以维护自身合法权益。
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