结论：在劳动仲裁中，若合同原件丢失且工资流水不全，您仍可通过收集其他证据来支持您的主张。以下是一些具体的建议和步骤，帮助您应对这一情况。
一、合同原件丢失的应对措施
寻找其他证据替代：
- 复印件或扫描件：如果您有合同的复印件或扫描件，这些文件在仲裁中仍可能被接受作为证据，尤其是当复印件或扫描件与原件内容一致，且对方无法提供反驳证据时。
- 电子邮件或聊天记录：如果您与雇主之间曾就合同内容通过电子邮件或聊天软件进行过沟通，这些记录也可以作为证明合同关系的证据。
- 证人证言：如果有同事或其他了解您与雇主之间合同关系的人愿意出庭作证，他们的证言也是有力的证据。
申请仲裁机构调查取证：
- 在某些情况下，您可以向劳动仲裁机构申请调查取证，要求仲裁机构要求雇主提供合同原件或其他相关证据。
二、工资流水不全的应对措施
收集其他工资支付证据：
- 银行转账记录：如果您是通过银行转账方式接收工资的，即使流水不全，您仍可以提供部分转账记录作为证据，并结合其他证据（如工资条、同事证言等）来证明您的工资水平。
- 工资条或收据：如果您有工资条或收据等书面证据，即使它们不是完整的工资流水，也能在一定程度上证明您的工资情况。
- 同事证言：同事的证言也可以作为证明您工资水平的辅助证据。
合理估算工资水平：
- 如果您确实无法提供完整的工资流水或其他直接证据，您可以根据自己的工作性质、岗位、行业平均水平等因素，合理估算自己的工资水平，并在仲裁中提供相应的说明和依据。
三、综合建议
- 全面收集证据：除了上述提到的证据外，您还应尽可能收集其他与劳动争议相关的证据，如工作证、考勤记录、工作成果等，以形成完整的证据链。
- 咨询专业律师：在准备仲裁材料和证据的过程中，如果您遇到任何疑问或困难，建议及时咨询专业律师。我可以根据您的具体情况，为您提供更具体的法律建议和指导。
- 注意仲裁时效：劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，从您知道或应当知道自己的权益受到侵害之日起计算。因此，请务必在时效期间内及时申请仲裁，以免丧失维权机会。
四、可能的法律后果
- 如果您能够提供足够的证据来支持您的主张，劳动仲裁机构可能会裁决雇主支付您应得的工资、经济补偿等。
- 如果您无法提供足够的证据，或者证据不足以支持您的主张，仲裁机构可能会驳回您的仲裁请求。因此，证据的收集和整理至关重要。
在处理劳动仲裁案件时，证据的充分性和完整性对于案件的胜诉至关重要。尽管合同原件丢失和工资流水不全可能会给您的维权带来一定的困难，但通过收集其他相关证据和合理估算工资水平，您仍有可能成功维护自己的合法权益。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。