针对违建小区的商品房，法院的判决会依据具体情况有所不同，但通常来说，主要会考虑以下几个方面：
违建的性质与程度：
- 如果违建部分属于严重违反规划、影响房屋结构安全或公共利益的，法院可能会认定该商品房买卖合同无效或部分无效。这是因为违建行为本身就违反了法律法规的强制性规定，损害了社会公共利益。
- 如果违建部分相对轻微，且不影响房屋的整体使用功能和安全，法院可能会根据具体情况，对合同效力进行部分认定，或者要求开发商进行整改以达到合法标准。
购房者的知情权：
- 如果购房者在购买时明知房屋存在违建情况，仍然选择购买，那么法院在判决时可能会考虑购房者的这一过错因素，对赔偿或退房等请求进行相应调整。
- 如果购房者在购买时并不知情，且开发商或销售方未履行告知义务，那么购房者有权要求解除合同、退房并获得相应赔偿。
合同条款的约定：
- 法院在判决时还会仔细审查商品房买卖合同中的相关条款，特别是关于房屋交付标准、产权登记、违约责任等方面的约定。如果合同中有明确约定违建情况的处理方式，法院通常会按照合同约定进行判决。
- 如果合同中没有明确约定或约定不明确，法院则会根据法律法规和公平原则，结合实际情况进行判决。
法律法规的适用：
- 法院在判决时还会依据相关法律法规，如《城乡规划法》、《城市房地产管理法》等，对违建行为进行定性，并据此确定开发商和购房者的权利义务。
- 如果违建行为涉及行政处罚，法院在判决时还可能会考虑行政处罚的结果和影响。
具体案例与法律后果：
- 在某些案例中，如果违建部分被认定为严重影响房屋使用功能和安全，法院可能会判决解除商品房买卖合同，要求开发商退还购房款并赔偿购房者因此遭受的损失。
- 在另一些案例中，如果违建部分相对轻微且可以整改，法院可能会判决开发商在规定期限内完成整改，并承担整改费用。如果开发商未能按时完成整改，购房者有权要求退房并获得相应赔偿。
建议与行动：
- 对于购房者来说，在购买商品房时一定要仔细审查房屋的相关证件和规划文件，确保房屋合法合规。如果发现房屋存在违建情况，应及时向开发商或销售方提出质疑并要求解释。
- 如果购房者已经购买了违建小区的商品房，且因此产生了纠纷，建议及时咨询专业律师，了解自己的权利和义务，并根据实际情况采取相应的法律行动。
总之，违建小区的商品房法院判决会依据具体情况有所不同，但通常会考虑违建的性质与程度、购房者的知情权、合同条款的约定以及法律法规的适用等因素。如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。