结论：关于过了三年公司催款，对方没有否认是否超过诉讼时效的问题，不能一概而论，需结合具体情况判断是否超过诉讼时效。

分析如下：

1. 诉讼时效的基本规定：

   • 根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。这意味着，在一般情况下，如果债权人在三年内未向债务人主张权利，则可能丧失通过诉讼途径追讨债务的权利。

2. 诉讼时效的中断与重新计算：

   • 诉讼时效并非一成不变，它可能因某些行为而中断，并重新计算。根据《民法典》第一百九十五条，有下列情形之一的，诉讼时效中断，从中断、有关程序终结时起，诉讼时效期间重新计算：（一）权利人向义务人提出履行请求；（二）义务人同意履行义务；（三）权利人提起诉讼或者申请仲裁；（四）与提起诉讼或者申请仲裁具有同等效力的其他情形。
   • 在您的情况下，如果公司在三年内曾向对方催款，且对方没有否认债务，这可能构成“义务人同意履行义务”的情形，从而导致诉讼时效中断并重新计算。但具体是否构成中断，还需根据催款的具体方式、内容以及对方的回应等证据来综合判断。

3. 对方没有否认债务的影响：

   • 对方没有否认债务，并不意味着诉讼时效一定未超过。关键在于是否在诉讼时效期间内采取了有效的法律行动（如催款、提起诉讼等）来中断诉讼时效。如果公司未在三年内采取任何行动，且没有其他诉讼时效中断的情形，那么诉讼时效可能已经届满。
   • 然而，如果公司在三年内催款，且对方虽然没有明确表示同意履行，但也没有明确拒绝或提出异议，这可能被视为一种默示的承认或接受，有可能构成诉讼时效中断的情形。但这也需要根据具体情况和证据来判断。

4. 建议与行动：

   • 鉴于诉讼时效问题的复杂性和不确定性，建议您尽快收集相关证据（如催款记录、对方回应等），并咨询专业律师以获取更准确的法律意见。
   • 如果诉讼时效确实已经届满，您可能需要考虑其他非诉讼途径来追讨债务，如协商、调解等。
   • 如果诉讼时效尚未届满或存在中断的情形，您应及时采取法律行动（如提起诉讼）来保护自己的合法权益。

总结：关于过了三年公司催款，对方没有否认是否超过诉讼时效的问题，不能仅凭时间来判断。需要结合具体情况、催款方式、对方回应以及相关证据来综合判断诉讼时效是否已经届满或存在中断的情形。如有需要，请尽快咨询专业律师以获取更准确的法律意见。