融资担保公司扣款是否合法，需视具体情况而定。以下是对此问题的详细分析：
合法扣款情形
存在合法有效约定：
- 若融资担保公司与债务人（或担保人）在合同中明确约定，当债务人未能按时履行还款义务时，融资担保公司有权直接从债务人（或担保人）的账户中扣划资金用于偿还贷款或履行担保责任，且该条款不违反法律法规的强制性规定，那么融资担保公司依据此条款扣款即为合法。例如，合同中明确规定“若债务人到期未还款，融资担保公司有权直接扣除债务人（或担保人）账户资金用于偿债”。
法定程序及条件成就：
- 在某些特定情况下，即使合同中没有明确约定，但根据法律规定，融资担保公司也可能有权扣划债务人（或担保人）的资金。例如，经过法院的生效判决确定债务人应偿还贷款，而债务人拒不履行，且担保人（若存在）承担连带担保责任时，法院可以依法强制执行债务人（或担保人）的财产，包括扣划其银行账户资金等。此时，融资担保公司作为债权人或担保权人，可以依据法院的强制执行裁定进行扣款。
综合担保情况：
- 当同一债权既有物的担保（如抵押、质押）又有人的担保（如保证）时，融资担保公司应遵循约定的实现债权方式。若合同中有明确约定，或按照法律规定的顺序实现债权，则融资担保公司的扣款行为可能合法。例如，若合同中约定先就物的担保实现债权，再要求保证人承担保证责任，融资担保公司遵循此约定扣款即为合法。
不合法扣款情形
未经授权或无合法依据：
- 若没有上述合法有效的约定或法定程序，融资担保公司擅自扣划债务人（或担保人）的资金是不合法的。例如，融资担保公司在未与债务人（或担保人）达成扣款协议，且没有获得法院强制执行裁定的情况下，私自通过技术手段扣划债务人（或担保人）账户资金，这种行为侵犯了债务人（或担保人）的财产权益，构成违法。
违反合同约定或法律规定：
- 若融资担保公司不遵循担保合同中的约定或法律规定的债权实现顺序，擅自扣划债务人（或担保人）资金，同样可能构成不合法。例如，在既有物的担保又有人的担保的情况下，若融资担保公司未先就物的担保实现债权，而是直接扣划担保人的资金，这种做法可能不符合合同约定或法律规定，因此是不合法的。
法律建议
- 审查合同条款：在签订融资担保合同时，务必仔细审查合同条款，特别是关于扣款、担保责任、债权实现方式等关键条款，确保自己的权益得到充分保障。
- 保留相关证据：若融资担保公司存在擅自扣款等违法行为，应立即保留相关证据，如银行转账记录、合同文本、沟通记录等，以便在必要时维护自己的合法权益。
- 寻求法律帮助：若遇到融资担保公司扣款纠纷，建议及时向我咨询，我将根据具体情况提供专业的法律意见和解决方案。
综上所述，融资担保公司扣款的合法性取决于具体情况，包括合同条款、相关法律规定以及实际情况。因此，在实际操作中，建议债务人和担保人在签订融资担保合同时务必明确约定扣款的相关事宜，并遵守相关法律法规的规定。