结论：个人买卖基本农田并用于砌房和牛棚的行为，很可能涉及违法，且因此引发的纠纷或违法行为，法院是否立案需视具体情况而定，但通常对于涉及非法占用农用地等违法行为的案件，法院是会依法受理的。
分析如下：
基本农田的法律保护：
- 根据我国相关法律法规，基本农田是受到严格保护的，任何单位和个人不得擅自改变其用途。买卖基本农田，尤其是用于非农业用途（如砌房和建牛棚），显然违反了这一规定。
违法行为的法律后果：
- 非法占用农用地，改变被占用土地用途，数量较大，造成农用地大量毁坏的，会构成非法占用农用地罪，依法应追究刑事责任。即使不构成犯罪，也会面临行政处罚，如罚款、责令恢复原状等。
法院立案的条件：
- 法院立案通常要求案件具有明确的被告、具体的诉讼请求和事实、理由，且属于法院受理范围。对于涉及非法占用农用地的案件，如果符合这些条件，法院是会依法受理的。
- 具体来说，如果有人因买卖基本农田并用于非农业用途而提起诉讼（如要求恢复原状、赔偿损失等），或者检察机关提起公诉（如非法占用农用地罪），法院都会根据相关法律法规进行审查，并决定是否立案。
可能涉及的纠纷类型：
- 如果是买卖双方之间的纠纷，可能涉及合同效力问题（如合同因违反法律强制性规定而无效）、违约责任问题等。
- 如果是与政府部门的纠纷，则可能涉及行政处罚的合法性、行政复议或行政诉讼等问题。
建议：
- 对于卖家：应立即停止违法行为，恢复土地原状，并主动与买家协商解决纠纷，避免法律风险的进一步扩大。
- 对于买家：如果已购买并使用了基本农田，也应认识到自己的行为可能违法，并考虑与卖家协商退还土地或寻求其他合法解决方案。
- 对于双方：如果无法自行解决纠纷，可以寻求法律援助或咨询专业律师，了解自己的权利和义务，以及可能的法律后果。
进一步思考：
- 在处理此类案件时，法院会综合考虑案件的具体情况、相关法律法规的规定以及社会公共利益等因素，作出公正的裁决。
- 此外，随着国家对农用地保护的日益重视，未来对于非法占用农用地的行为可能会采取更加严厉的打击措施。因此，建议各方在涉及农用地的问题上务必谨慎行事，遵守相关法律法规。
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