在废标的情况下，是否收取代理费主要取决于招标代理合同的约定以及废标的原因。以下是对这一问题的详细分析：

1. 合同约定优先：

   • 招标代理合同是招标人和招标代理机构之间设立、变更、终止民事权利义务关系的协议。合同中通常会明确约定代理费的支付条件、支付方式以及废标情况下的处理方式。
   • 如果合同中明确规定，无论招标结果如何，招标代理机构都有权收取全额或部分代理费，那么即使废标，招标代理机构也有权按照合同约定收取费用。
   • 反之，如果合同中约定废标后不收取代理费或只收取部分费用，那么招标代理机构应遵守合同约定，不得擅自收取全额费用。

2. 废标原因的影响：

   • 废标可能由于多种原因导致，如招标文件存在重大缺陷、投标人数量不足、投标报价均超过预算等。这些原因可能涉及招标人、招标代理机构或投标人的责任。
   • 如果废标是由于招标代理机构的原因导致的，如招标文件编制错误、招标程序违法等，那么招标代理机构可能无权收取代理费，甚至可能需要承担赔偿责任。
   • 如果废标是由于不可抗力或其他非招标代理机构原因导致的，那么招标代理机构是否有权收取代理费，应依据合同约定来确定。

3. 实际操作中的考虑：

   • 在实际操作中，招标代理机构通常会与招标人在合同中明确约定废标情况下的代理费支付问题，以避免纠纷。
   • 如果合同未明确约定，双方可以协商解决。协商不成的，可以根据相关法律法规和行业惯例来处理。例如，可以参照类似项目的代理费支付情况，或者寻求法律途径解决。

建议：

• 对于招标人来说，在签订招标代理合同时，应仔细阅读合同条款，特别是关于代理费支付和废标处理的部分，确保自己的权益得到保障。
• 对于招标代理机构来说，应严格按照合同约定和法律法规开展业务，避免因自身原因导致废标而引发纠纷。
• 如果双方在废标后对代理费支付问题存在争议，建议及时咨询专业律师，通过法律途径解决纠纷。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。