有限公司的股权在特定情形下是可以约定回购的。这一结论主要基于《中华人民共和国公司法》的相关规定，以下是对此问题的详细解答：
一、法律依据与特定情形
根据《中华人民共和国公司法》第七十四条，有限公司在以下特定情形下，对股东会该项决议投反对票的股东可以请求公司按照合理的价格收购其股权：
公司连续五年不向股东分配利润，而公司该五年连续盈利，并且符合本法规定的分配利润条件的：
- 若公司连续五年盈利却未分配利润，损害了股东获取投资收益的权益，对此持反对意见的股东有权要求公司回购其股权。
公司合并、分立、转让主要财产的：
- 当公司发生合并、分立或转让主要财产等重大变更时，这些变化可能对公司的经营方向和股东权益产生深远影响。若股东对此类变更持反对意见，可以要求公司以合理价格回购其股权。
公司章程规定的营业期限届满或者章程规定的其他解散事由出现，股东会会议通过决议修改章程使公司存续的：
- 如果公司章程中规定的营业期限届满，或出现章程中规定的其他解散事由，但股东会通过决议修改章程以使公司继续存续，对于这一决定持反对意见的股东，同样有权请求公司回购其股权。
二、回购程序与注意事项
回购程序：
- 召开股东会：就股权回购事宜作出决议，并确保决议内容合法合规。
- 通知股东：将回购决议通知相关股东，并告知回购的价格、方式等具体事项。
- 签订协议：公司与股东签订股权回购协议，明确双方的权利和义务。
- 办理变更登记：完成股权回购后，需依法向公司登记机关办理变更登记手续。
注意事项：
- 回购价格的确定：股权回购的价格应合理公正，通常可以参考公司的净资产、市场估值等因素来确定。
- 资金来源：公司应确保用于回购股权的资金来源合法合规，不得损害公司或其他股东的利益。
- 信息披露：在进行股权回购时，公司应及时向其他股东披露相关信息，保障股东的知情权。
- 法律风险防范：公司应咨询专业律师（如我）的意见，确保回购行为符合法律法规的要求，避免潜在的法律风险。
三、其他相关情形与规定
- 公司解散时的股权回购：根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国公司法〉若干问题的规定（二）》第五条，公司在解散时，股东尚未缴纳的出资应作为清算财产，包括到期应缴未缴的出资以及分期缴纳尚未届满缴纳期限的出资等。在此过程中，也可能涉及股权回购的问题。
- 避免滥用权利：公司不得滥用股权回购权利损害股东或其他利益相关者权益。若回购导致公司注册资本减少，需确保公司偿债能力不受影响，必要时需通知债权人并进行公告。
- 遵循公司章程：公司章程可对股权回购作出特别约定，但需符合法律规定。例如，公司章程可以约定在特定条件下（如股东离职、退休等）公司有权回购其股权。
四、实际案例与操作建议
在实际操作中，有限公司回购股东股权的情况并不罕见。例如，某公司因业务转型需要转让主要财产，部分股东对此持反对意见并要求公司回购其股权。在此情况下，公司应按照法定程序召开股东会、通知股东、签订回购协议并办理变更登记手续。同时，公司应确保回购价格合理、资金来源合法合规，并充分披露相关信息以保障股东的知情权。
总结来说，有限公司的股权在特定情形下是可以约定回购的。这一制度设计旨在保护股东的合法权益并确保公司的稳定运营。然而，回购过程需严格遵循公司章程及相关法律法规的规定以确保合法性和公正性。如果您在有限公司股权回购方面有任何疑问或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。